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自身炎症和PLCγ2相关的抗体缺乏和免疫失调
编辑人员丨2天前
自身炎症和磷脂酶Cγ2(PLCγ2)相关的抗体缺乏和免疫失调(APLAID)是一种由PL-CG2基因突变引起的罕见自身炎症性疾病(AIDs),其临床特点复杂多样,多不具有特异性,发病机制尚未达成统一共识,临床工作中难以鉴别,明确诊断往往需要综合病史、临床表现和基因检测等多方面分析.本文就APLAID的发病机制与临床表型进行综述,以期为APLAID的诊断和治疗提供参考.
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编辑人员丨2天前
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FGG基因Ala315Gly错义突变致遗传性异常纤维蛋白原血症家系分析
编辑人员丨2天前
目的 对1个FGG基因Ala315Gly错义突变导致的遗传性异常纤维蛋白原血症家系进行表型和基因突变分析,探讨该错义突变与遗传性异常纤维蛋白原血症的相关性.方法 收集2021年12月同济大学附属东方医院胶州医院某先证者临床资料及其家系成员(共3代8人)相关信息,并进行凝血表型检测.分析先证者纤维蛋白原(Fib)基因外显子和侧翼序列;采用反向测序验证先证者突变位点,采用Sanger测序检测其家系成员相应的突变位点.将家系测序结果与NCBI数据库序列进行比对,分析变异与表型的共分离情况.分析突变位点基因的保守性,并通过生物信息学在线分析软件预测突变位点对蛋白质功能的潜在影响.分析突变前后蛋白质空间结构和分子间作用力.结果 先证者Fib活性为0.97 g·L-1(降低).其母亲、小姨、外祖父Fib活性均降低;除母亲凝血酶时间(TT)延长外,先征者及其家系其他人员的凝血表型均在参考区间内.与健康对照相比,先证者及其母亲、小姨、外祖父凝血酶诱导的纤维蛋白最大聚集率和聚集曲线斜率显著降低.先证者FGG(4q31|NM_000509.4)基因exon8:c.944C>G:p.(Ala315Gly)杂合错义突变,ACMG证据级别为致病突变,且该突变位点类型为国际新发现突变.先证者母亲、小姨、外祖父均为Ala315Gly杂合子,父亲、大姨、舅舅、外祖母该位点为野生型,FGG基因c.944C>G突变在该家系与先证者表型共分离.A315位点在同源物种间高度保守;生物信息学在线分析软件预测Ala315Gly突变会影响Fib的聚集功能;蛋白质模型分析结果表明,Ala315与Trp395、Thr397、Ala367和Gly318等周围的氨基酸残基侧链形成疏水作用,突变后疏水作用消失,且突变改变了该蛋白的自由能,使蛋白稳定性降低.结论 Fib c.944C>G错义突变可导致其氨基酸周围失去疏水相互作用,进而改变蛋白的自由能,降低空间结构的稳定性,最终可能导致遗传性异常纤维蛋白原血症的发生.
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编辑人员丨2天前
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基于脑MRI的机器学习预测非小细胞肺癌T790M突变
编辑人员丨2天前
目的:本研究基于脑部T1C和T2W MRI建立人工智能模型,预测肺癌脑转移患者在靶向治疗中的耐药性T790M突变.方法:本研究收集 80 例肺癌脑转移患者(2017 年 6 月—2019 年 12 月)的T1C和T2W MRI影像和临床数据进行回顾性分析(患者按照 2∶1 的比例分成训练集和测试集).采用无监督k-means算法将肿瘤区域划分为高亮度区域和低亮度区域,提取不同区域的影像组学图像特征构建模型,评估每个模型的诊断效果.绘制受试者工作特征(Receiver operating characteristic,ROC)曲线,计算ROC曲线下面积(Area under curve,AUC)、特异性和敏感性作为模型评价指标,分析模型的潜在临床应用价值.结果:对T1C和T2W MRI和临床特征融合的统计计算表明,本研究建立的模型对T790M突变具有良好的预测能力,在训练集和测试集上的AUC分别为 0.899 和 0.818.结论:本研究建立的计算机模型可以有效预测肺癌脑转移患者T790M突变,具有潜在的临床辅助诊断价值.
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编辑人员丨2天前
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ABO亚型分子遗传学分析及罕见等位基因鉴定
编辑人员丨2天前
目的 研究95例血清学ABO亚型标本的分子机制.方法 对95例血清学ABO正反定型不符亚型标本全部进行血清学确认和聚合酶链反应-序列特异性(PCR-SSP)ABO基因分型,对PCR-SSP无法检测到亚型等位基因的标本分别先后进行ABO基因第1~7外显子双链测序和单链测序,以确定突变位点以及突变点所在基因位置.结果 95例标本共检测出34个ABO等位基因.其中5个常见ABO等位基因(ABO*A1.01、ABO*A1.02、ABO*B.01、ABO*O.01.01和ABO*O.01.02)和29个罕见亚型等位基因,包括16个ISBT命名等位基因(ABO*A2.01、ABO*A2.05、ABO*A2.13、ABO*A3.07、ABO*AW.37、ABO*AEL.05、ABO*B3.01、ABO*B3.05、ABO*BW.03、ABO*BW.07、ABO*BW.27、ABO*BEL.03、ABO*cisAB.01、ABO*cisAB.05、ABO*BA.02、ABO*BA.04)和 5 个 dbRBC 曾命名等位基因(A223、B309、Bw37、Bel09、Bw40)和 8 个均未命名新等位基因[ABO*B.01+978C>A、ABO*A1.02+248A>T、ABO*B.01+125dupT、ABO*B.01+(98+1 G>A)、ABO*A1.02/ABO*B.01+1A>G,ABO*A1.02/ABO*O.01.01+28G>T,ABO*A1.02/ABO*B.01+538C>T,ABO*A1.02/ABO*O.01.01+797insT,后4个标本因标本量不足无法进行单链测序验证].95例标本通过PCR-SSP确认亚型等位基因76例(21个ISBT和dbRBC已命名等位基因),剩余19例标本进行ABO基因第1~7外显子测序确认,其中确认8例未命名等位基因标本,剩余11例标本经测序未发现在检测范围内的亚型等位基因.结论 研究揭示了 95例血清学ABO亚型的分子遗传学背景,发现8种罕见的未命名新等位基因.血清学疑难血型的检测受到患者病理、生理等因素的干扰,ABO亚型鉴定需要血清学检测和基因检测相结合.
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编辑人员丨2天前
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妊娠合并抗凝血酶缺陷症的基因检测和分析
编辑人员丨2天前
目的 对1例妊娠合并遗传性抗凝血酶(AT)缺陷症患者进行基因检测和分析.方法 收集患者的临床资料,检测其血浆抗凝血酶活性(AT:A)、凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT)、纤维蛋白原(Fib)、D-二聚体(DD)、纤维蛋白原降解产物(FDP)、蛋白C活性(PC:A)、蛋白S活性(PS:A)等凝血指标.对患者的PROC、PROS1、SERPINC1、SERPIND1、PLG、PROCR、THBD、ADAMTS13、HRG、TFPI、CPB2、HABP2、PLAT、PLAU、SERPINA10、SERPINE1、SERPINF2、CALR、GP6、JAK2、MPL和凝血因子相关基因的转录起始点、5'-非翻译区(UTR)、编码区、剪切点8 bp内含子序列区域、转录终止子点突变、小缺失/重复和剪切位点进行突变检测.采用Sanger测序验证变异位点.对变异位点进行生物信息学分析,以明确致病性.结果 患者AT:A降低.基因检测结果显示,患者SERPINC1基因第2号外显子发生c.380G>A(p.Cys127Tyr)杂合突变,JAK2基因第10号外显子发生c.1324G>C(p.Glu442Gln)杂合突变,SERPINA10基因第2号外显子发生c.389T>G(p.Leu130Trp)杂合突变.SERPINC1基因c.380G>A(p.Cys127Tyr)变异在正常人群公共SNP数据库(ExAC数据库、1000G dbSNP13数据库和gnomAD数据库)中未被收录,ClinVar数据库、OMIM数据库和HGMD数据库中均未见该变异位点的相关报道,PolyPhen-2、MutationTaster和CADD在线软件预测其为致病性变异.JAK2基因c.1324G>C(p.Glu442Gln)变异和SERPINA10基因c.389T>G(p.Leu130Trp)评级均为意义不明确的变异.Sanger测序结果显示3个变异均存在.蛋白模拟结构分析结果显示,SERPINC1基因c.380G>A(p.Cys127Tyr)变异可导致蛋白结构改变,从而影响蛋白功能.结论 SERPINC1基因c.380G>A(p.Cys127Tyr)变异可能导致遗传性AT缺陷症.监测凝血相关指标,及时进行分子诊断,有助于改善遗传性AT患者的妊娠结局.
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编辑人员丨2天前
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奥布替尼联合利妥昔单抗及大剂量甲氨蝶呤治疗初治原发中枢神经系统淋巴瘤的疗效分析
编辑人员丨2天前
目的 通过回顾性研究分析奥布替尼联合利妥昔单抗及大剂量甲氨蝶呤(RMO方案)治疗新诊断原发中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)患者的临床疗效和安全性.方法 收集2021年1月—2023年1月在我院治疗的初治PCNSL患者资料.所有患者均接受RMO方案治疗:奥布替尼片150 mg口服,1次/d,d1~21;利妥昔单抗375 mg·m-2静脉滴注,d1;甲氨蝶呤注射液3.5 g·m-2静脉滴注3 h,d2;21 d为1个治疗周期.所有患者均治疗6个周期,每2个周期后进行疗效评估,6个周期治疗结束后行PET-CT及脑核磁评估疗效.治疗结束后,符合移植条件者行自体造血干细胞移植巩固治疗,有条件者进行奥布替尼维持治疗.观察患者的临床疗效及不良反应.结果 共纳入12例患者,中位年龄58(45~74)岁,病理类型均为CD20阳性弥漫大B细胞淋巴瘤.治疗4个周期后疗效评估为完全缓解(CR)4例、部分缓解(PR)7例、疾病进展(PD)1例,CR率为33.3%,客观缓解率(ORR)为91.7%.治疗6个周期后疗效评估为CR 8例、PR 2例、PD 2例,CR率为66.6%,ORR为83.3%.中位无进展生存期(mPFS)未达到,中位总生存期(mOS)未达到,6个月PFS率为83.3%,6个月OS率为100%,12个月PFS率为64.8%,12个月OS率为80.8%.有8例患者接受基因突变检测,其中MCD型7例、A53型1例.7例MCD型患者接受治疗后ORR为100%,CRR为85.7%.主要不良反应为疲劳(25.0%),仅有1例不良反应≥3级,最常见的血液学毒性为白细胞减少(16.7%),所有患者均未发生房颤及肾功能衰竭.结论 RMO方案对于初治PCNSL患者是安全、有效的治疗方案.
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编辑人员丨2天前
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荧光PCR熔解曲线法在耐多药结核病诊治中的应用及分析
编辑人员丨2天前
目的 探讨荧光聚合酶链反应(PCR)熔解曲线法在耐多药结核病(MDR-TB)的快速诊断和有效药物快速筛选中的应用价值.方法 以利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、氟喹诺酮类(FQs)为检测药物,应用熔解曲线法和微孔板药敏法,对比检测2021年1~7月贵阳市公共卫生救治中心罗氏固体培养阳性的84株菌株.两种方法药敏结果不一致的菌株用基因测序法作验证.结果 以微孔板法为标准,熔解曲线法对MDR-TB(微孔板诊断)的检出符合率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值依次为89.3%(75/84)、91.5%(43/47)、86.5%(32/37)、89.6%(43/48)、88.9%(32/36)、0.78.溶解曲线法对RFP、INH、EMB、FQs的检出符合率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为76.2%~97.6%、86.7%~95.7%、73.9%~100%、41.9%~100%、94.1%~98.6%和0.45~0.95.对22份(26.19%,22/84)微孔板法敏感、熔解曲线法耐药的菌株进行测序验证,结果均显示含有耐药突变;而微孔板法耐药、熔解曲线法敏感的6份(0.71%,6/84)菌株在测序区域均为野生型.结论 荧光PCR熔解曲线法对微孔板药敏法检测结果的灵敏度、特异度、符合率、一致性均较高,可为耐多药结核病的初筛诊断及治疗方案制定提供实验室依据.
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编辑人员丨2天前
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MAP3K7、MPO基因与中国人群坏疽性脓皮病发病的相关性研究
编辑人员丨2天前
目的:对中国人群坏疽性脓皮病患者进行基因检测,明确相关突变.方法:收集坏疽性脓皮病患者外周血,提取DNA并进行目标基因二代测序,使用样本库中对照样本全外显子数据进行基因负荷检验,并对可能与坏疽性脓皮病发病相关的突变位点使用Sanger测序验证.结果:共收集36例坏疽性脓皮病患者,在4例患者的5个基因中发现了 6个有害性突变位点.包括一个移码突变:NLRP12:c.908delT(p.F303fs)和 5 个错义突变:MAP3K7:c.815C>G(p.S272C),MPO:c.1484C>T(p.T495I),MPO:c.1705C>T(p.R569W),NOD2:c.2975G>A(p.R992Q),SYK:c.389A>G(p.E130G).其中MAP3K7的杂合突变和MPO的纯合(复合杂合)突变仅存在于病例组.结论:本研究发现了MAP3K7(P=7.44E-02),MPO(P=7.44E-02)有害性突变可能与中国人群的坏疽性脓皮病相关.
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编辑人员丨2天前
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吉特曼综合征合并低钙血症1例报道
编辑人员丨2天前
吉特曼综合征(gitelman syndrome,GS)又称家族性低钾-低镁血症,大多数GS病例与位于 16q13染色体上的SLC12A3基因的双等位基因失活突变有关,该染色体编码位于远曲小管顶膜的噻嗪敏感氯化钠共转运体,少部分是由编码氯通道CLCNKB基因突变所致[1].GS临床表现隐匿,与巴特综合征(bartter syndrome,BS)临床表现极为相似,临床难以区分[2].
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编辑人员丨2天前
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青年合并骨质疏松的Gitelman综合征1例
编辑人员丨2天前
Gitelman综合征又称家族性低钾低镁血症,其患病率约为 1 ~ 10/40 000[1]. 该病是由 SLC12A3基因突变引起的,导致远曲小管上噻嗪类利尿剂敏感的氯化钠共转运蛋白(sodium-chloride co-trans-porter, NCCT)功能障碍.
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编辑人员丨2天前