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非小细胞肺癌顺铂耐药相关微小RNA的生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:筛选非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药相关微小RNA(miRNA,miR)并分析其生物学功能。方法:从高通量基因表达数据库(GEO)中搜索并下载与非小细胞肺癌顺铂耐药相关的miRNA芯片数据,并通过Targetscan和miRanda预测miRNA的靶基因,对靶基因行基因本体(GO)生物学进程分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并构建蛋白与蛋白相互作用网络图(PPI);进一步对KEGG通路行网路分析,并结合与顺铂耐药存在显著相关性的miRNA,构建miR-KEGG网路。组间数据比较采用 t检验。 结果:共筛选到GSE84200、GSE43249和GSE56036 3个数据库,总计23个与顺铂耐药相关的miRNA。Targetscan和miRanda共同预测的靶基因共计914个。GO功能富集分析表明这些基因主要以蛋白结合,信号传导和正性调节基因转录等生物学过程相关。KEGG通路分析显示这些基因主要参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)等信号通路。PPI网路分析结合关键基因分析显示p53为关键基因。miR-KEGG网络分析显示miR-195-5p和miR-424-5p在顺铂耐药中发挥重要作用。结论:miR-195-5p和miR-424-5p可能在顺铂耐药中发挥重要作用,生物学分析预测有助于进一步认识miRNA在非小细胞肺癌顺铂耐药中的功能。
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-424-5p靶向驱动蛋白家族成员23促进肝癌细胞对索拉非尼的敏感性
编辑人员丨5天前
目的:探索微小RNA-424-5p/驱动蛋白家族成员23(miR-424-5p/KIF23)轴对肝癌细胞恶性表型及其对索拉非尼敏感性的影响。方法:实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和/或蛋白免疫印迹法检测miR-424-5p和KIF23在肝癌组织及癌旁组织、人肝癌细胞HepG2及正常肝细胞LO2中的表达情况。将分别转染miR-424-5p模拟物(mimic)和miR-424-5p mimic 对照(NC)的HepG2细胞作为miR-424-5p mimic组和mimic NC组;将分别转染KIF23过表达载体pcDNA3.1-KIF23和空载体pcDNA3.1的HepG2细胞作为OE-KIF23组和Vector对照组,将同时转染miR-424-5p mimic和过表达载体pcDNA3.1-KIF23的HepG2细胞作为mimic+OE-KIF23组。将KIF23-3’UTR野生型载体(KIF23-WT)和突变型载体(KIF23-MT)分别与miR-424-5p mimic和mimic NC进行共转染,并用双荧光素酶报告实验验证miR-424-5p与KIF23的靶向关系;细胞计数试剂盒(CCK-8)检测各组HepG2细胞增殖及其对索拉非尼的敏感性;流式细胞术评估各组HepG2细胞凋亡情况;Transwell和划痕实验检测各组HepG2细胞迁移和侵袭能力。组间数据比较采用 t检验或方差分析。 结果:与癌旁组织和正常肝细胞相比,肝癌组织和肝癌细胞的miR-424-5p均显著下调(相对表达量分别为0.604±0.121,0.585±0.064),KIF23显著上调(相对表达量分别为5.451±1.834,2.482±0.545), P值均<0.05。miR-424-5p mimic可抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,促进肝癌细胞的凋亡( P值均<0.05)。过表达KIF23可促进肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,抑制肝癌细胞的凋亡( P值均<0.05)。与mimic NC和KIF23-WT共转染组HepG2细胞相比,mimic和KIF23-WT共转染组HepG2细胞的荧光素酶活性显著降低(相对荧光强度分别为:3.668±0.091、2.629±0.056, P<0.01),而mimic和KIF23-MT共转染组与mimic NC和KIF23-MT共转染组细胞的荧光素酶活性相比,差异无统计学意义。miR-424-5p mimic可逆转过表达KIF23对肝癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的促进作用( P值均<0.05)。索拉非尼对mimic+OE-KIF23组和OE-KIF23组HepG2细胞的抑制率分别为47.491%±3.863%和36.246%±6.063%( t=3.027, P<0.05)。 结论:miR-424-5p可通过靶向调控KIF23的表达水平抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并提高肝癌细胞对索拉非尼的敏感性。
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编辑人员丨5天前
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脓毒症并发急性肾损伤患儿血清中miR-93-5p和miR-424-5p的表达及临床意义
编辑人员丨3周前
目的 探讨血清中微小RNA-93-5p(miR-93-5p)和微小RNA-424-5p(miR-424-5p)在脓毒症并发急性肾损伤(S-AKI)患儿中的表达水平及其临床意义.方法 选取2019年11月至2021年11月南阳市中心医院综合ICU收治的116例脓毒症患儿作为研究对象,根据脓毒症患儿是否并发AKI分为AKI组60例和非AKI组56例;比较两组患儿的一般资料和血清miR-93-5p、miR-424-5p及肾功能指标[血肌酐(Scr)、胱抑素C(Cys-C)]水平;采用Pearson法分析S-AKI患儿血清miR-93-5p、miR-424-5p与肾功能指标的相关性;采用多因素Logistic回归分析脓毒症患儿并发AKI的影响因素;采用受试者工作特征曲线(ROC)分析血清miR-93-5p、miR-424-5p水平对脓毒症患儿并发AKI的诊断价值.结果 AKI组患儿的尿量为(1.52±0.31)mL·kg-·1 h-1、血清miR-93-5p表达水平为0.62±0.14,均明显低于非AKI组的(1.87±0.36)mL·kg-·1 h-1、(1.02±0.21),急性生理学与慢性健康状况评分(APACHEⅡ评分)、序贯器官衰竭评分(SOFA评分)、血清miR-424-5p表达水平、Scr、Cys-C水平分别为(17.35±5.01)分、(5.77±1.80)分、(2.36±0.51)、(182.84±43.31)μmol/L、(1.63±0.39)mg/L,明显高于非AKI组的(14.96±4.12)分、(5.10±1.41)分、(1.01±0.23)、(91.51±28.34)μmol/L、(0.96±0.28)mg/L,差异均有统计学意义(P<0.05);经Pearson法分析结果显示,S-AKI患儿血清miR-93-5p与Scr、Cys-C呈负相关(r=-0.621、-0.720,P<0.05),miR-424-5p与Scr、Cys-C呈正相关(r=0.503、0.538,P<0.05);经多因素Logistic回归分析结果显示,miR-424-5p、Scr、Cys-C是影响脓毒症患儿并发AKI的危险因素,miR-93-5p是保护因素(P<0.05);经ROC分析结果显示,血清miR-93-5p、miR-424-5p以及两者联合诊断脓毒血症患儿并发AKI的AUC分别为0.856、0.860、0.949,联合诊断的敏感度为90.00%,特异性为91.07%,两者联合优于血清miR-93-5p、miR-424-5p各自单独诊断(Z 两者联合-miR-93-5p=2.897、Z 两者联合-miR-424-5p=2.706,P=0.004、P= 0.007).结论 S-AKI患儿血清miR-93-5p水平显著下调,miR-424-5p水平显著上调,两者联合诊断脓毒血症患儿并发AKI具有更高价值.
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编辑人员丨3周前
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lncRNA NEAT1调节miR-424-5p/ELK4轴对ox-LDL诱导的血管内皮细胞损伤、Lp-PLA2和CRP水平的影响
编辑人员丨1个月前
目的:探讨长链非编码 RNA核旁斑组装转录本 1(lncRNA NEAT1)在氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导的血管内皮细胞损伤中的分子机制和功能.方法:收集健康人和动脉粥样硬化(AS)病人血液标本并通过实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清中 lncRNA NEAT1、微小 RNA-424-5p(miR-424-5p)和 ETS域蛋白 4(ELK4)mRNA表达水平.体外培养人脐静脉内皮细胞(HUVEC),qRT-PCR和蛋白免疫印迹法(Western Blot)检测细胞中lncRNA NEAT1、miR-424-5p和ELK4表达情况;细胞计数试剂盒(CCK-8)法和膜联蛋白 V-异硫氰酸荧光素/碘化丙啶(Annexin V-FITC/PI)法检测 HUVEC细胞增殖活力和凋亡情况;酶联免疫吸附法(ELISA)测定HUVEC中乳酸脱氢酶(LDH)释放量、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素(IL)-1β含量、脂蛋白磷脂酶A2(Lp-PLA2)和C反应蛋白(CRP)水平;采用双荧光素酶报告基因测定 lncRNA NEAT1、miR-424-5p和 ELK4 之间的靶向相互作用.进行动物实验以评估 lncRNA NEAT1在体内 AS进展中的作用.结果:lncRNA NEAT1在 AS病人血清和ox-LDL诱导的 HUVEC中显著上调(P<0.05).lncRNA NEAT1的沉默可削弱 ox-LDL引发的细胞毒性,降低 Lp-PLA2和CRP水平,并减少ApoE-/-小鼠的脂质异常分泌(P<0.05).miR-424-5p是 lncRNA NEAT1在调节 ox-LDL诱导的 HUVEC损伤中的功能介质,ELK4是miR-424-5p的直接靶标(P<0.05).miR-424-5p的抑制或ELK4的过表达逆转了lncRNA NEAT1沉默对ox-LDL诱导的HUVEC细胞损伤的影响(P<0.05).结论:沉默lncRNA NEAT1可通过调控 miR-424-5p/ELK4轴保护 HUVEC免受 ox-LDL触发的细胞毒性,降低 Lp-PLA2和 CRP水平.
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编辑人员丨1个月前
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微小RNA-424-5P靶向调控HMGA1基因对胃癌细胞生长、侵袭的影响
编辑人员丨2023/11/11
目的 研究微小RNA(miR)-424-5P对高迁移率族蛋白(HMG)A1 的靶向调控及对胃癌细胞增殖、迁移的作用.方法 将人胃癌BGC-823 细胞复苏后,应用 10%胎牛血清,在 5%二氧化碳和 37℃培养箱中进行培养,应用miR-424-5P抑制物(inhibitor)转染的BGC-823 细胞列为anti-miR-424-5P组.应用阴性对照进行转染的BGC-823 细胞列为anti-NC组,不进行转染的BGC-823 细胞列为对照组,细胞转染后各组继续在培养箱中培养.应用qRT-聚合酶链反应(PCR)检测各组miR-424-5P的相对表达水平;应用四甲基噻唑蓝(MTT)研究miR-424-5P对细胞增殖的影响;应用划痕实验检测miR-424-5P对细胞迁移的影响;应用transwell实验研究miR-424-5P对细胞侵袭的影响.应用免疫印迹实验对各组HMGA1 蛋白相对表达水平进行检测.结果 转染 48 h后qRT-PCR结果表明,anti-miR-424-5P组miR-424-5P相对表达量明显低于对照组和anti-NC组(P<0.05).对BGC-823 细胞进行转染 48 h后,miR-424-5P OD值显著低于anti-NC组和对照组(P<0.05).与anti-NC组和对照组相比,anti-miR-424-5P组迁移距离显著较低(P<0.05).与anti-NC组和对照组相比,anti-miR-424-5P 组迁移数量显著较少(P<0.05).与对照组和anti-NC组比较,anti-miR-424-5P组HMGA1 蛋白的表达水平显著较高(P<0.05).结论 miR-424-5P能够靶向调控HMGA1 对胃癌细胞的生长、侵袭,可为胃癌的治疗提供新的靶点和治疗策略.
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编辑人员丨2023/11/11
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肺炎支原体感染诱发哮喘患儿血清中miR-424-5p和CX3CL1表达水平及与预后预测价值研究
编辑人员丨2023/8/19
目的 检测肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)感染诱发哮喘患儿血清中微小核糖核酸(micro RNA,miR)-424-5p和CX3CL1 表达水平及其与患儿预后的关系.方法 选取 2020 年 3 月~2021 年 5 月在内江市第一人民医院进行治疗的MP感染患儿128例作为研究对象,根据是否诱发哮喘分为哮喘组(n=82)和MP组(n=46),另选取50 例健康儿童作为对照组.分别比较哮喘组、MP组和对照组血清miR-424-5p,CX3CL1,IgE,IL-6,TNF-α水平和肺功能指标;根据哮喘患儿预后情况分为预后良好组(n=50)和预后不良组(n=32),分析哮喘患儿预后情况与临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier法分析MP诱发哮喘患儿血清中miR-424-5p和CX3CL1表达与患儿预后的关系;采用多因素Logisitic回归分析MP诱发哮喘患儿预后的影响因素.结果 对照组、MP组和哮喘组血清miR-424-5p(0.95±0.26,1.12±0.35,1.34±0.39),CX3CL1(0.47±0.08,0.62±0.17,0.91±0.22 ng/ml),Ig E(22.64±5.74,41.26±8.91,52.31±10.26 IU/ml),IL-6(5.26±0.90,8.24±1.07,9.14±1.18 ng/L)和 TNF-α(55.27±10.54,88.56±18.67,105.26±26.48 pg/ml)水平依次升高,差异具有统计学意义(F=20.287,103.274,174.470,205.317,87.349,均P<0.05).对照组、MP组和哮喘组肺功能指标VC(80.24±19.35,62.35±15.48,51.26±12.38 ml),FVC(78.35%±18.29%,60.21%±16.34%,48.36%±11.73%)和FEV1(63.31%±17.26%,44.26%±10.31%,38.69%±9.58%)依次降低,差异具有统计学意义(F=54.943,61.821,63.006,均P<0.05).哮喘患儿预后良好组血清Ig E,IL-6,TNF-α,miR-424-5p和CX3CL1 水平均明显低于预后不良组,差异具有统计学意义(t=3.825,6.137,3.086,4.003,6.044,均P<0.05).Kaplan-Meier法分析显示,血清miR-424-5p低表达组和CX3CL1 低表达组患儿预后良好率高于高表达组(χ2=4.377,4.172,均P<0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,Ig E,IL-6,TNF-α,miR-424-5p和CX3CL1水平为MP诱发哮喘患儿预后的影响因素(P<0.05).结论 MP诱发哮喘患儿血清miR-424-5p和CX3CL1水平上调,且二者水平变化与患儿预后情况密切相关.
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编辑人员丨2023/8/19
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miR-424-5 p过表达对乳腺癌细胞增殖和迁移能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨miR-424-5p过表达对乳腺癌细胞增殖和迁移能力的影响.方法 体外传代培养人乳腺癌细胞MCF-7(以下称MCF-7细胞).取传3代、对数生长期、生长状态良好的MCF-7细胞,随机分为miR-424-5p组、阴性对照组、空白对照组,miR-424-5p组、阴性对照组分别转染miR-424-5p mimics、miRNA negative control,空白对照组不予转染.收集各组转染48 h细胞,采用real-time PCR法检测miR-424-5p表达;采用MTT法检测转染48 h再培养0、24、48、72 h细胞增殖能力,采用细胞划痕实验检测转染48 h再培养24 h细胞迁移能力.结果 miR-424-5p组miR-424-5p相对表达量明显高于阴性对照组和空白对照组(P均<0.05),而阴性对照组与空白对照组比较P>0.05.miR-424-5p组转染48 h再培养72 h细胞增殖能力明显低于阴性对照和空白对照组(P均<0.01),而三组转染48 h再培养0、24、48 h组间两两比较P均>0.05.miR-424-5p组细胞迁移能力明显低于阴性对照组和空白对照组(P均<0.01),而阴性对照组与空白对照组比较P>0.05.结论 miR-424-5p过表达能抑制乳腺癌细胞增殖和迁移能力.miR-424-5p有可能成为治疗乳腺癌的一个潜在靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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微小RNA-424-5p调控OTX1对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究结直肠癌组织中微小RNA-424-5p(miR-424-5p)与orthodenticle人同源盒基因1(OTX1) mRNA表达的关系,并探讨miR-424-5p对结直肠癌HCT116细胞增殖、迁移和侵袭的影响.方法 收集2017年6月至2018年6月在昆明医科大学第三附属医院结直肠外科收治的60例结直肠癌患者,采用实时定量PCR (RT-qPCR)检测miR-424-5p和OTX1 mRNA在60对结直肠癌组织和癌旁组织以及结直肠癌HCT116细胞中的表达情况,并分析两者表达的相关性.HCT116细胞分别转染miR-NC(miR-NC组)和miR-424-5 p-mimic(miR-424-5p-mimic组),采用CCK-8法、细胞划痕实验、Transwell实验分别检测miR-424-5p对HCT116细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;Western blotting检测过表达miR-424-5p对OTX1蛋白表达的影响.荧光素酶报告实验检测miR-424-5p对OTX1-3'UTR报告载体荧光素酶活性的影响.结果 OTX1 mRNA在结直肠癌组织和癌旁组织中的相对表达量分别为1.049±0.446和0.639±0.178(t=-6.583,P<0.001);miR-424-5p在结直肠癌组织和癌旁组织中的相对表达量分别为0.865±0.261和1.329±0.387(t=7.705,P<0.001),差异均有统计学意义.结直肠癌组织中miR-424-5p和OTX1 mRNA的表达呈负相关(r=-0.439,P=0.015).HCT116细胞转染miR-424-5p-mimic后第72、96和120 h时吸光度(A)值分别为0.813 ±0.064、0.960±0.098、1.287±0.192,转染miR-NC后第72、96和120 h时A值分别为1.163 ±0.158、1.645 ±0.117、2.043±0.236,miR-424-5p-mimic组细胞增殖能力显著低于miR-NC组,差异均具有统计学意义(t=3.538,P=0.024;t=7.778,P=0.001;t=4.257,P=0.013).划痕实验结果显示,划痕24 h后miR-424-5p-mimic组与miR-NC组相比迁移能力显著减弱.miR-NC组和miR-424-5p-mimic组穿膜细胞数分别为(177.104±17.834)个和(35.667±13.634)个,差异有统计学意义(t=15.246,P<0.001).OTX1蛋白在miR-NC组和miR-424-5p-mimic组中的相对表达量分别为0.862 ±0.121、0.342±0.103,差异有统计学意义(t=16.286,P<0.001).荧光素酶实验结果显示,过表达miR-424-5p后,wt-OTX1-3'UTR和mut-OTX1-3'UTR报告载体的荧光素酶活性分别为0.305±0.095和0.898±0.080,差异有统计学意义(P<0.001).结论 miR-424-5p与OTX1mRNA在结直肠癌组织中的表达呈负相关,miR-424-5p可通过下调OTX1的表达抑制结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/6
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微小RNA-138靶向调控EZH2表达及对甲状腺癌细胞侵袭迁移的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨微小RNA-138(miR-138)对zeste同源增强子2( EZH2)的靶向调控作用及甲状腺癌细胞8505C侵袭迁移的影响.方法 miR_pathway在线分析miR-138在甲状腺癌组织中的表达及调控的生物学过程;脂质体法向8505C细胞转染miR-138模拟物(过表达组)或阴性对照序列(NC组)并设未转染的细胞为对照组,采用实时定量PCR( QPCR)检测miR-138水平,活细胞计数CCK-8试剂盒检测增殖情况,划痕实验和Transwell小室实验分别检测划痕愈合率和穿膜细胞数, QPCR检测EZH2、基质金属蛋白酶-9( MMP-9)、Janus激酶1(JAK1)和信号转导和转录激活因子3( STAT3)的mRNA水平, Western blotting检测EZH2、MMP-9、JAK1、磷酸化JAK1(p-JAK1)、STAT3、磷酸化STAT3( p-STAT3)和MMP-9的蛋白水平;双荧光素酶报告基因实验验证miR-138对EZH2的靶向调控作用.结果 miR_pathway在线分析发现miR-138在甲状腺癌中调控多个生物学过程,且在甲状腺癌组织中的表达低于正常组织(P<0. 05).过表达组的miR-138水平为12. 657±2. 263,高于对照组的1. 025±0. 087和NC组的1. 109±0. 097(P<0. 05);与对照组和NC组相比,过表达组转染24、48 h的细胞增殖活力降低(P<0. 05).过表达组的划痕愈合率和穿膜细胞数目分别为( 22. 571± 2. 168)%和(152. 3± 16. 5)个,低于对照组的(59. 424± 3. 624)%和(287. 4±17. 5)个及NC组的(61. 280±4. 035)%和(278. 5±16. 3)个( P<0. 05);miR-138模拟物对EZH2野生型3’端非翻译区的荧光素酶活性有抑制作用( P<0. 05),但对突变型无影响(P>0. 05).与其余两组相比,过表达组的 MMP-9、EZH2、p-JAK1和p-STAT3水平降低(P<0. 05),而JAK1和STAT3水平的差异无统计学意义( P>0. 05).对照组和NC组上述指标的差异无统计学意义(P>0. 05).结论 miR-138在甲状腺癌组织中低表达,且该miRNA在甲状腺癌中发挥抑制增殖和侵袭迁移的抑癌作用,可能与靶向调控EZH2和JAK1/STAT3/MMP-9通路有关,有作为甲状腺癌治疗候选靶点的潜能.
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编辑人员丨2023/8/6
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microRNA在肺动脉高压进展中作用及机制的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
微小RNA(miRNA)在肺动脉高压(PAH)发生发展过程中发挥重要作用,参与了PAH的起始、进展以及失代偿期.研究发现,miR-17、miR-20、miR-27、miR-143/145、miR-210、miR-221、miR-451等miRNA可促进PAH进展,而miR-34、miR-96、miR-140-5p、miR-223、miR-204/424/503等miRNA可延缓PAH进展.miRNA参与PAH进展的机制既包括肺动脉平滑肌细胞的增殖、凋亡、表型转化等经典途径,还包括miR-124-PTBP1-PKM信号轴、内皮素1、雌激素及其代谢产物16α-羟雌酮等新的途径.
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编辑人员丨2023/8/5