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基于GINS家族成员在胶质瘤组织中的表达水平对其进行分型及其临床意义
编辑人员丨6天前
目的:基于GINS家族成员在胶质瘤组织中表达水平对其分型,探究此分型预测胶质瘤患者的预后、免疫治疗疗效的有效性,采用TCMOI数据库虚拟筛选可靶向GINS的中药小分子.方法:数据库分析GINS基因组学、胶质瘤组织中差异表达基因与患者预后的关系,基于GINS家族成员基因表达对胶质瘤进行分型并分析各亚型的预后情况,数据库数据分析各亚型中的基因突变、基因富集、肿瘤纯度和免疫细胞浸润评分,以及与GINS2可能相互作用的中药小分子,最后用qPCR法检测中国人胶质瘤组织中GINS1~4 mRNA的表达水平以验证其与数据库数据的一致性.结果:GINS家族各成员间的基因、蛋白结构和功能相似,胶质瘤组织中GINS家族成员呈高表达且与患者不良预后密切相关(P<0.05),基于GINS家族成员在胶质瘤组织中表达水平的S1、S2亚型分类能较好地预测胶质瘤患者的预后,S1亚型主要突变基因为CDKN2A/B、EGFR、PTEN而S2亚型的突变基因为IDH1、TP53和ATRX,GINS家族可能通过调控免疫微环境影响胶质瘤患者预后,CD276和CX3CL1可能是S1亚型胶质瘤患者实施免疫治疗的潜在靶点,CHEMBL66033、266935、293914、436859、1594881可能是潜在的靶向GINS2的中药小分子.结论:基于GINS家族构建的胶质瘤分子分型有助于识别更适合免疫治疗的高风险患者,筛选出的中药小分子可为胶质瘤患者分子靶向治疗和免疫治疗提供参考.
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编辑人员丨6天前
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C-X3-C基序趋化因子配体1/C-X3-C基序趋化因子受体1通路参与失血性休克/复苏大鼠记忆功能恢复
编辑人员丨6天前
目的 探讨C-X3-C基序趋化因子配体 1(CX3CL1)/C-X3-C基序趋化因子受体 1(CX3CR1)通路调控的小胶质细胞活化对失血性休克/复苏大鼠记忆功能的影响.方法 实验分为 2 部分.第 1 部分,将大鼠随机分为假手术组,模型-0.5 h组,模型-1.5 h组,模型-3h组,每组 10 只,模型组之间失血性休克时间存在差异.第 2部分,大鼠随机分为对照组与CX3CL1 组,每组 10 只.CX3CL1 组大鼠脑室注射CX3CL1 蛋白,对照组大鼠注射生理盐水.所有大鼠在模型制作前开展Morris水迷宫训练,模型制作后 4d,开展水迷宫测试.完成后,取全脑组织进行HE染色与免疫组织化学染色,取脑脊液检测炎性细胞因子含量,取脑组织进行Real-time PCR检测与Western blotting检测.结果 与假手术组相比,模型组大鼠逃避潜伏期增加,穿越平台次数与第Ⅲ象限停留时间减少,且HE染色中显示神经元状态受损.此外,与假手术组相比,模型组大鼠脑组织中离子钙结合衔接分子 1(Iba1)表达升高,脑脊液中肿瘤细胞坏死因子α(TNF-α)与白细胞介素(IL)-6含量升高,M1 型小胶质细胞标记CD16、TNF-α、IL-1β与诱导性一氧化氮合酶(iNOS)mRNA 含量升高.与此同时,与假手术组相比,模型组大鼠脑组织中CX3CL1、CX3CR1 蛋白表达降低,磷酸化核因子 κB(p-NF-κB)与核苷酸结合寡聚结构域(NOD)样受体蛋白 3(NLRP3)蛋白表达升高.然而,与模型组相比,CX3CL1 组大鼠逃避潜伏期减少,穿越平台次数与第Ⅲ象限停留时间增加,且神经元状态恢复.此外,与对照组相比,CX3CL1 组大鼠脑组织中 Iba1 表达降低,脑脊液中 TNF-α与IL-6 含量降低,M1 型小胶质细胞标记CD16、TNF-α、IL-1β与iNOS mRNA含量降低,M2 型小胶质细胞标记CD206、转化生长因子β(TGF-β)、精氨酸酶 1(Arg1)、几丁质酶 3 样蛋白 1(Ym1)mRNA含量升高.结论 CX3CL1 有助于抑制小胶质细胞过度激活,诱导小胶质细胞向M2 型极化,抑制M1 型极化,降低炎性细胞因子释放,减轻失血性休克/复苏诱发的记忆功能损伤.
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编辑人员丨6天前
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通过转录组测序和生物信息学方法鉴别小胶质细胞炎症激活过程中的关键通路和基因
编辑人员丨6天前
目的:通过转录组测序和生物信息学分析,探究小胶质细胞炎症激活的关键通路和基因。方法:使用质量浓度为1 μg/ml的脂多糖对小胶质细胞进行刺激,建立小胶质细胞炎症模型。使用ELISA法和RT-qPCR检测小胶质细胞炎症模型IL-6和TNF-α水平。对建立的小胶质细胞炎症模型进行转录组测序,采用生物信息学方法筛选出差异表达基因。对差异表达基因进行GO分析和KEGG分析。使用String数据库构建差异表达基因的蛋白互作网络,并使用Cytoscape软件进行蛋白互作网络的可视化。使用MCODE应用程序提取蛋白互作网络的模块,使用cytohubba应用程序提取枢纽基因。采用RT-qPCR验证枢纽基因的mRNA表达水平。对枢纽基因进行富集分析,预测其靶向miRNA,预测可能与其作用的药物。结果:经ELISA和RT-qPCR检验,小胶质细胞炎症模型建立成功。通过转录组测序和生物信息学分析,筛选出434个差异表达基因。GO分析显示这些差异表达基因主要集中在细胞对细胞因子刺激的反应、炎症反应、对外界刺激反应的调节等条目。KEGG分析显示这些差异表达基因主要集中在趋化因子信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等通路。构建了这些差异表达基因的蛋白互作网络图,并进行了模块分析和枢纽基因的提取,枢纽基因大部分位于模块1内,模块1的种子基因为 S1pr1,枢纽基因包括 S1pr1、 Cxcr4、 Cx3cl1、 Cx3cr1、 Cxcl10、 Cxcl2、 Ccl4、 Ccl5、 Ccl9、 Fpr1。RT-qPCR结果显示,与培养液组相比,脂多糖组中 S1pr1、 Cxcr4、 Cx3cl1、 Cx3cr1的mRNA表达下调, Cxcl10、 Cxcl2、 Ccl4、 Ccl5、 Ccl9、 Fpr1的mRNA表达上调。枢纽基因的富集分析主要集中在趋化因子介导的信号通路、视紫红质样受体、细胞趋化性等条目。预测了可能和枢纽基因作用的miRNA和药物。 结论:通过对小胶质细胞炎症模型进行转录组测序和生物信息学分析,筛选出了差异表达基因,提取了枢纽基因和种子基因,有助于进一步理解小胶质细胞炎症的分子机制,为相关疾病的诊治提供潜在的靶点。
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编辑人员丨6天前
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趋化因子CX3CL1及其受体CX3CR1在阿尔茨海默病中的作用研究进展
编辑人员丨6天前
阿尔茨海默病(Alzheimer's disease, AD)的发病原因及机制目前尚未明确。近年来,趋化因子CX3CL1及其受体CX3CR1在多种神经退行性病变中的作用获得了广泛关注。文章主要阐述趋化因子CX3CL1及其受体CX3CR1的结构与功能,CX3CL1及其受体CX3CR1与AD的关系,CX3CL1及其受体CX3CR1在AD发生和发展中的作用机制以及CX3CL1的受体外途径,为后续研究提供参考依据。
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编辑人员丨6天前
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来氟米特与硫唑嘌呤对老年狼疮性肾炎患者血清趋化细胞因子组织蛋白酶及血管细胞黏附分子-1的影响
编辑人员丨6天前
目的:分析来氟米特与硫唑嘌呤对老年狼疮性肾炎患者血清趋化细胞因子CX3CL1(Fractalkine)、组织蛋白酶(cathepsin S)及血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)的影响。方法:选取我院2017年1月至2019年7月收治的60例老年狼疮性肾炎患者作为研究对象。按随机数字表法分为两组,30例采用来氟米特+常规治疗(来氟米特组),30例采用硫唑嘌呤+常规治疗(硫唑嘌呤组)。检测两组治疗前、治疗后6个月、9个月和12个月血清Fractalkine、cathepsin S及尿VCAM-1水平并进行统计学分析。结果:两组治疗后血清Fractalkine水平均下降( F=123.029、99.041,均 P=0.000),来氟米特组治疗后6个月血清Fractalkine水平[(2.34±0.95)μg/L]低于硫唑嘌呤组[(2.97±1.01)μg/L],( t=2.489, P=0.016);两组治疗后血清cathepsin S水平均下降( F=106.733和64.928,均 P=0.000),来氟米特组治疗后6个月和9个月血清cathepsin S水平[(24.31±3.15)、(21.72±2.67)μg/L]低于硫唑嘌呤组[(26.92±4.02)、(23.89±2.75)μg/L]( t=2.799、3.101, P=0.007,0.003);两组治疗后尿VCAM-1水平均下降( F=907.450和858.114,均 P=0.000),来氟米特组治疗后6个月尿VCAM-1水平(74.36±9.17)μg/LCr,低于硫唑嘌呤组(86.91±9.22)μg/L Cr( t=5.286, P=0.000);两组患者不良反应发生率均较低,对比差异无统计学意义。 结论:来氟米特与硫唑嘌呤均能有效降低老年狼疮性肾炎患者血清Fractalkine、cathepsin S及尿VCAM-1水平,提示二者在抑制炎症反应、细胞基质降解与重塑、血管细胞黏附方面作用相当,但在治疗前期来氟米特的效果要优于硫唑嘌呤,临床可根据具体情况酌情选择。
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编辑人员丨6天前
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趋化因子CX3C配体1在原发性干燥综合征合并间质性肺疾病中的临床意义
编辑人员丨6天前
目的:探讨趋化因子CX3C配体1(CX3CL1)在pSS合并间质性肺疾病(ILD)中的临床意义。方法:纳入2019年12月至2020年12月桂林医学院附属医院风湿免疫科就诊的pSS患者共103例[合并ILD 42例(pSS-ILD组),非ILD 61例(pSS组)],桂林医学院附属医院健康体检中心健康体检者46名(健康对照组);收集入组患者的基本资料、临床表现、临床指标、肺功能、肺高分辨率CT(HRCT)及血清标本;ELISA法检测CX3CL1、涎液化糖链抗原-6(KL-6)在3组血清中的水平,分析CX3CL1与pSS-ILD和pSS患者的临床相关指标的相关性。采用独立样本 t检验。Kruskal-Wallis H检验、Pearson相关、Logistic回归分析方法进行统计学分析。 结果:①CX3CL1、KL-6在pSS-ILD组比pSS组、健康对照组高[CX3CL1:9.08(3.97,30.56)ng/ml、8.12(6.16,8.89)ng/ml与7.09(5.86,9.07)ng/ml, H=3.53, P=0.019;KL-6:19.08(8.05,24.72)mU/ml、15.9(4.52,19.26)mU/ml与12.74(8.09,16.23)mU/ml, H=9.85, P=0.008];CX3CL1与KL-6呈正相关性( r=0.82, P<0.001)。②CX3CL1的截断值为:9.07 ng/ml,特异度为86.9%,灵敏度为43.6%。受试者工作特征曲线下面积为0.603。③CX3CL1与一氧化碳弥散量占预计值百分比( r=-0.45, P=0.004)、HRCT评分( r=-0.54, P<0.001)、肺动脉高压( r=0.37, P=0.039)、EULAR关于SS疾病活动指数(ESSDAI)( r=0.36, P=0.049)、胸闷气促( r=0.49, P<0.001)有相关性。 结论:血清CX3CL1与KL-6、肺纤维化病变及肺功能损伤程度成正比,趋化因子CX3CL1在一定程度上能帮助pSS-ILD的诊断及病情评估。
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编辑人员丨6天前
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CX3CL1/CX3CR1在脑缺血中的作用及其机制
编辑人员丨6天前
CX3CL1亦称分形趋化因子,是趋化因子CX3C亚类中的唯一成员,通过与其特异性受体CX3CR1结合,在多种中枢神经系统疾病和缺血性脑血管病中发挥重要作用。近年来,大量研究对CX3CL1/CX3CR1的具体作用和相关分子机制进行了探讨。本文就CX3CL1/CX3CR1在缺血性脑血管病中的作用和相关分子机制进行综述,旨在拓展对CX3CL1/CX3CR1作用机制的认识,为缺血性脑血管病的预防、诊断及治疗提供新的思路与干预靶点。
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编辑人员丨6天前
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趋化因子受体CX3CR1促进单核来源朗格汉斯细胞亚群局部重建维持慢性皮肤炎症反应
编辑人员丨6天前
目的:探讨趋化因子受体CX3CR1在慢性皮肤炎症反应中的作用及调控机制。方法:通过二硝基氟苯诱导野生型(wild type,WT)和 Cx3 cr1 GFP/GFP基因缺陷小鼠制备急性和慢性变应性接触性皮炎(allergic contact dermatitis, ACD)模型,HE染色检测小鼠耳朵炎症变化及耳朵肿胀程度,流式细胞术(flow cytometry, FCM)分析小鼠表皮朗格汉斯细胞(Langerhans cell, LC)亚群包括经典LC和单核来源LC(monocyte-derived LC, Mo-LC)比例的变化,同时使用紫外线(ultraviolet, UV)照射诱导小鼠皮肤炎症反应模型进行相应细胞亚群的FCM分析;FCM分析Mo-LC表型及功能变化包括主要组织相容性复合体Ⅱ(major histocompatibility complex Ⅱ,MHCⅡ)、诱导型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS)、TNF-α的表达水平。免疫组化法、定量RT-PCR和Western blot分析人慢性皮肤炎症组织中CX3CL1表达水平,免疫荧光染色检测CD1a、CD14及CD207表达。 结果:在慢性ACD模型中, Cx3 cr1 GFP/GFP小鼠耳朵炎性程度和肿胀程度比WT小鼠明显减轻,而在急性ACD模型中两组差异无统计学意义。Mo-LC细胞比例在慢性ACD模型及UV照射后期(3周)明显降低。此外,与经典LC比较,Mo-LC表达高水平MHCⅡ分子以及炎性因子TNF-α和iNOS。在人慢性皮肤炎症皮损组织中CX3CL1表达水平明显上调,CD14 +单核细胞、CD1a +Langerin -细胞明显增多。 结论:CX3CR1在慢性皮肤炎症中可能通过调控Mo-LC局部重建而维持炎症反应。
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编辑人员丨6天前
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肥胖症脂肪组织中环状RNA表达水平及功能研究
编辑人员丨6天前
目的:分析肥胖症内脏脂肪组织中环状RNA(circRNA)表达水平。方法:留取北京朝阳医院2020年1月至9月收治患者的内脏脂肪组织,根据体重指数,分肥胖(>32.5 kg/m 2)和正常组(<20.0 kg/m 2),选取10份(肥胖组6份,正常组4份)行全转录组测序,比较circRNA表达水平并利用生物信息学方法分析其功能。以Log2(Fold change>1)且 P<0.05筛选差异化表达的circRNA,以 P<0.05为条件筛选富集的通路和分子功能。 结果:与正常组比较,肥胖组有52个差异表达的circRNA[Log2 (Fold change)>1,且 P<0.05],其宿主基因主要富集在"胰岛素抵抗"、"肿瘤坏死因子通路"和"细胞因子-因子受体通路"等通路( P<0.05),筛选出上述通路中的关键基因,如趋化因子(CX3CL1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、白细胞介素6(IL-6)、胰岛素受体底物2(ISR2)等,这些基因与慢性炎性反应密切相关。 结论:circRNAs可能通过调控慢性炎性反应在肥胖症发生发展中发挥作用。
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编辑人员丨6天前
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地佐辛复合全身麻醉对老年患者趋化因子CXC配体8信使核糖核酸、微小核糖核酸-124-3p、微小核糖核酸-143-3p表达水平影响
编辑人员丨2周前
目的 探讨地佐辛复合全身麻醉对老年患者趋化因子CXC配体8(CXCL8)信使核糖核酸(mRNA)、微小核糖核酸-124-3p(miR-124-3p)、微小核糖核酸-143-3p(miR-143-3p)表达水平的影响.方法 选取四川大学华西医院自 2020 年 5 月至2023 年5 月收治的498 例老年全身麻醉患者为研究对象.将患者随机分入常规组和地佐辛组,每组各 249 例.地佐辛组麻醉诱导前静脉给予地佐辛,常规组给予氯化钠,随访至术后1d.比较两组患者麻醉诱导和麻醉苏醒的相关指标;同时,比较两组患者术前和术后1d的CXCL8 mRNA、miR-124-3p、miR-143-3p表达水平,以及疼痛和认知功能相关指标.结果 两组患者气管插管后1 min的收缩压、心率均高于麻醉诱导前,差异有统计学意义(P<0.05).与常规组比较,地佐辛组苏醒期躁动和呛咳的发生率更低,苏醒时间和拔管时间更短,差异有统计学意义(P<0.05).与术前比较,两组患者术后 1d的CXCL8 mRNA、miR-143-3p水平升高,miR-124-3p水平降低,差异有统计学意义(P<0.05);地佐辛组术后1d的CXCL8 mRNA、miR-143-3p水平低于常规组,miR-124-3p水平高于常规组,差异有统计学意义(P<0.05).与术前比较,两组患者术后1d的视觉模拟评分法(VAS)评分升高,简易智能精神状态量表(MMSE)评分、中文版蒙特利尔认知评估量表(MOCA)评分降低,差异有统计学意义(P<0.05);地佐辛组术后1d的VAS评分低于常规组,MMSE评分、MOCA评分高于常规组,差异有统计学意义(P<0.05).结论 地佐辛复合全身麻醉不会影响老年患者的麻醉诱导相关指标,但会改善麻醉苏醒相关指标,调节CX-CL8 mRNA、miR-124-3p、miR-143-3p表达水平,减轻疼痛,促进认知功能恢复.
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编辑人员丨2周前