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CDKN1B在结直肠癌中的表达及其与患者临床病理特征的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨结直肠癌CDKN1B表达与临床病理特征的关系及预后意义。方法:利用人类蛋白谱(HPA)数据库和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析CDKN1B在人结直肠癌组织中的表达情况及其与结直肠癌患者预后的相关性。回顾性分析扬州大学医学院宜兴临床学院自2020年1月至2021年12月经手术治疗的98例结直肠癌患者资料,收集病理标本。采用免疫组织化学法检测结直肠癌及癌旁正常组织(距癌灶2 cm)中CDNK1B蛋白表达水平,分析CDNK1B表达与患者临床病理特征的相关性。结果:经既往生物信息学分析结果及HPA数据库、GEPIA数据库预测提示CDKN1B在结直肠癌中表达水平较正常结直肠组织低;HPA数据库中,CDKN1B高表达患者(425例)5年总生存率高于低表达患者(172例)(65%比51%),两组总生存差异有统计学意义( P<0.001);应用GEPIA数据库分期模块分析显示,CDKN1B基因表达水平与结直肠癌患者病理分期相关( P=0.033)。免疫组织化学法检测显示,CDKN1B定位于细胞核和细胞质。结直肠癌组织中CDKN1B高表达者比例低于癌旁正常组织[18.37%(18/98)比90.82%(89/98), P<0.01]。低分化[低分化比高-中分化:3.70%(1/27)比23.94%(17/71)]、淋巴结转移[转移比未转移:6.38%(3/53)比29.41%(15/45)]、TNM分期越高[Ⅳ期比Ⅲ期比Ⅱ期比Ⅰ期:5.00%(1/20)比13.95%(3/33)比20.59%(8/30)比36.36%(6/15)]结直肠癌患者癌组织CDKN1B高表达者比例均较低(均 P<0.05),患者性别、年龄、肿瘤大小亚组间癌组织CDKN1B高表达者比例差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:CDKN1B主要表达于细胞核和细胞质,在结直肠癌组织中低表达;其表达越低,提示患者预后越差。CDKN1B可能成为结直肠癌临床诊疗与预后评估的标志物。
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编辑人员丨1周前
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SMC4基因在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨1周前
目的:分析染色体结构维持蛋白4( SMC4)基因在脑胶质瘤中的表达情况及其临床意义。 方法:(1)下载中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库中749例胶质瘤组织的 SMC4 mRNA表达数据及其患者的临床资料。采用单因素和多因素Cox回归分析明确胶质瘤患者预后不良的独立影响因素。绘制并比较 SMC4 mRNA高表达组、 SMC4 mRNA低表达组患者的生存曲线。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析 SMC4 mRNA对患者1、3、5年生存率的预测效能。(2)使用基因表达谱数据动态分析(GEPIA)评价癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胶质瘤组织的 SMC4 mRNA表达水平与其患者总生存率的关系。通过人类蛋白质图谱(HPA)在线数据库测定高级别胶质瘤(胶质母细胞瘤)、低级别胶质瘤中SMC4蛋白的表达。(3)基因组富集分析比较 SMC4 mRNA高表达组、 SMC4 mRNA低表达组胶质瘤间基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的差异。采用基因共表达分析与 SMC4 mRNA存在相关关系的基因。 结果:(1)多因素Cox回归分析显示 SMC4 mRNA( HR=1.314, 95%CI:1.209~1.428, P=0.000)、原发-复发-继发(PRS)类型、WHO分级、年龄、化疗、异柠檬酸脱氢酶( IDH)突变和染色体1p/19q缺失是胶质瘤患者预后不良的独立影响因素。生存分析显示 SMC4 mRNA低表达组患者的总生存率高于 SMC4 mRNA高表达组,差异有统计学意义( P<0.05)。ROC曲线分析显示, SMC4 mRNA预测患者1年、3年和5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.712、0.784、0.791。(2)低级别、高级别胶质瘤中 SMC4 mRNA表达水平均高于正常对照脑组织,差异均有统计学意义( P<0.05)。低级别胶质瘤中 SMC4 mRNA低表达组患者的总生存率高于 SMC4 mRNA高表达组,差异有统计学意义( P<0.05)。高级别胶质瘤中 SMC4 mRNA低表达组与 SMC4 mRNA高表达组患者的总生存率差异无统计学意义( P>0.05)。低级别胶质瘤组织中SMC4蛋白表达显著低于高级别胶质瘤。(3)基因组富集分析显示 SMC4 mRNA高表达组胶质瘤中富集的GO是凝聚核染色体、驱动蛋白复合体、减数分裂细胞周期、减数分裂细胞周期过程;富集的KEGG通路包括细胞周期、DNA复制、错配修复、P53信号通路、胰腺癌等相关通路。基因共表达分析显示与SMC4 mRNA表达呈正相关关系的前5个基因为苯并咪唑出芽抑制解除同源物蛋白1(BUB1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(WEE1)、着丝粒蛋白L(CENPL)、驱动蛋白超家族23(KIF23)、Shugoshin样蛋白2(SGOL2),与 SMC4 mRNA表达呈负相关关系的前5个基因为F框/WD40域蛋白4(FBXW4)、副肿瘤样抗原-L2(PNMAL2)、成熟酶蛋白K(MATK)、PASL10A、长链编码基因CTD-2210P24.4。 结论:SMC4 mRNA表达水平较高的胶质瘤患者预后较差, SMC4 mRNA为高危因素,可作为胶质瘤患者的独立预后指标,其生物学功能与胶质瘤的DNA复制相关。
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编辑人员丨1周前
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LRRK2G2019S位点突变通过抑制自噬相关蛋白诱发驱铁处理后小胶质细胞的活化
编辑人员丨1周前
目的:探讨LRRK2G2019S位点突变对驱铁处理后小胶质细胞活化的影响及其机制。方法:(1)利用人类诱导多能干细胞(IPSC)经造血祖细胞(HPC)分化产生小胶质细胞,免疫荧光染色进行鉴定,利用蛋白纯化技术获取α-突触核蛋白(α-syn)A53T突变蛋白。(2)将小胶质细胞分为对照组、α-syn组、α-syn+甲磺酸去铁胺(DFO)组,分别加入磷酸盐缓冲液(PBS)、1 μmol/L纯化的α-syn A53T突变蛋白、1 μmol/L纯化的α-syn A53T突变蛋白+30 mmol/L DFO作用24 h。采用比色法检测细胞Fe 2+浓度,Western blotting实验检测细胞Rab35蛋白的表达,流式细胞仪检测细胞内活性氧(ROS)水平,实时定量聚合酶链式反应(RT-PCR)检测细胞白细胞介素( IL) -6、肿瘤坏死因子α( TNF-α)、转化生长因子β( TGF-β)mRNA的表达。将3组小胶质细胞培养上清液(MCS)转移到SH-SY5Y细胞中,采用流式细胞仪检测SH-SY5Y细胞的凋亡情况。(3)双向DNA测序检测1 μmol/L纯化的α-syn A53T突变蛋白处理后小胶质细胞富亮氨酸重复激酶2( LRRK2)基因的突变。将小胶质细胞分为对照组、α-syn组、α-syn+GSK3357679A组,分别加入对应的药物处理24 h(LRRK2抑制剂GSK3357679A浓度为10 nmol/L),采用Western blotting实验检测细胞LRRK2蛋白的表达。将小胶质细胞分为对照组、α-syn组、α-syn+GSK3357679A、α-syn+GSK3357679A+DFO组,分别加入对应的药物处理24 h后采用Western blotting实验检测细胞Rab35蛋白的表达,流式细胞仪检测细胞内ROS水平,RT-PCR检测细胞 IL-6、 TNF-a、 TGF-β mRNA的表达。(4)将小胶质细胞分为对照组、α-syn组、α-syn+雷帕霉素(RAPA)组,分别加入对应的药物处理24 h(自噬诱导剂RAPA的浓度为50 nmol/L),采用Western blotting实验检测细胞Rab35、P62、微管相关蛋白轻链3Ⅱ(LC3Ⅱ)蛋白的表达,流式细胞仪检测细胞内ROS水平,RT-PCR检测细胞 IL-6、 TNF-α、 TGF-β mRNA的表达。(5)将小胶质细胞分为对照组、α-syn组、α-syn+Rab35组,分别加入对应的药物处理24 h(Rab35过表达质粒的浓度为1 μg/mL),采用Western blotting实验检测细胞Rab35、P62、LC3Ⅱ蛋白的表达,流式细胞仪检测细胞内ROS水平,RT-PCR检测细胞 IL-6、 TNF-α、 TGF-β mRNA的表达。 结果:(1)免疫荧光染色检测显示小胶质细胞神经元核蛋白(NeuN)表达阴性、离子钙结合适配分子1(Iba1)表达阳性、LRRK2呈高表达。成功构建PcDNA3.1-SNCA-A53T表达质粒并纯化获得α-syn A53T突变蛋白。(2)α-syn组细胞Fe 2+浓度高于对照组,α-syn+DFO组细胞Fe 2+浓度低于α-syn组,差异均有统计学意义( P<0.05)。对照组、α-syn组、α-syn+DFO组细胞Rab35蛋白、 TGF-β mRNA的表达依次降低, IL-6、 TNF-a mRNA的表达依次增加,差异均有统计学意义( P<0.05)。对照组、α-syn组、α-syn+DFO组小胶质细胞ROS水平、SH-SY5Y细胞凋亡率均依次增加。(3)双向DNA测序显示α-synA53T突变蛋白刺激后小胶质细胞LRRK2G2019S突变最明显。与对照组比较,α-syn组细胞LRRK2蛋白的表达增高;与α-syn组比较,α-syn+GSK3357679A组细胞LRRK2蛋白的表达降低,差异有统计学意义( P<0.05)。与对照组比较,α-syn组细胞Rab35蛋白、 TGF-β mRNA的表达降低, IL-6、 TNF-a mRNA的表达增高;与α-syn组比较,α-syn+GSK3357679A组细胞Rab35蛋白、 TGF-β mRNA的表达增高, IL-6、 TNF-a mRNA的表达降低;与α-syn+GSK3357679A组比较,α-syn+GSK3357679A+DFO组细胞Rab35蛋白、 TGF-β mRNA的表达降低, IL-6、 TNF-a mRNA的表达增加,差异均有统计学意义( P<0.05)。α-syn组细胞ROS水平高于对照组,α-syn+GSK3357679A组细胞ROS水平低于α-syn组,α-syn+GSK3357679A+DFO组细胞ROS水平高于α-syn+GSK3357679A组。(4)与对照组比较,α-syn组细胞Rab35、LC3Ⅱ蛋白、 TGF-β mRNA的表达降低,P62蛋白、IL-6、 TNF-a mRNA的表达升高;与α-syn组比较,α-syn+RAPA组细胞Rab35、LC3Ⅱ蛋白、 TGF-β mRNA的表达升高,P62蛋白、 IL-6、 TNF-a mRNA的表达降低,差异均有统计学意义( P<0.05)。α-syn组细胞ROS水平高于对照组和α-syn+RAPA组。(5)与对照组比较,α-syn组细胞Rab35、LC3Ⅱ蛋白、 TGF-β mRNA的表达降低,P62蛋白、 IL-6、 TNF-a mRNA的表达升高;与α-syn组比较,α-syn+Rab35组细胞Rab35、LC3Ⅱ蛋白、 TGF-β mRNA的表达升高,P62蛋白、 IL-6、 TNF-a mRNA的表达降低,差异均有统计学意义( P<0.05)。α-syn组细胞ROS水平高于对照组和α-syn+Rab35组。 结论:在驱铁处理条件下,LRRK2G2019S能通过抑制Rab35等自噬相关蛋白诱发小胶质细胞活化,Rab35有望成为干预神经炎症反应的关键因素。
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编辑人员丨1周前
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高分组前列腺癌组织中PCDH9表达缺失且与p53、Rb、STAT3的表达相关
编辑人员丨3周前
目的 探讨前列腺癌中原钙黏蛋白9(PCDH9)的表达缺失在调控细胞周期、促进肿瘤进展中的作用.方法 选取南充市中心医院病理科2018-2023年存档的前列腺癌样本127例,其中根据世界卫生组织/国际泌尿病理协会分级标准(WHO/ISUP)分组为G4~5组的石蜡组织标本87例,G1~3组的石蜡组织标本40例.应用免疫组织化学染色检测前列腺癌组织中PCDH9和细胞周期相关蛋白人类肿瘤抑制蛋白53(p53)、视网膜母细胞瘤(Rb)肿瘤抑制蛋白及信号转导和转录激活因子3(STAT3)的表达情况,分析其表达与临床病理特征的关系.结果 PCDH9在G4~5组前列腺癌组织中的表达缺失率(44.8%vs.7.5%)显著高于G1~3组(P<0.001).G4~5组前列腺癌组织中p53、STAT3的阳性表达率分别为34.5%、89.7%,Rb的表达缺失率为27.6%.PCDH9、Rb的表达缺失与是否伴有神经内分泌样组织学形态、神经侵犯和脉管侵犯相关(P<0.05).高分组前列腺癌组织中,PCDH9 表达与 p53(r=0.345,P<0.05)、Rb(r=0.503,P<0.05)及 STAT3(r=0.224,P<0.05)的表达呈正相关.结论 PCDH9在高分组前列腺癌组织中易发生表达缺失,且表达缺失患者常伴有神经内分泌样组织学形态,高分组前列腺癌中PCDH9表达缺失可能通过STAT3信号通路调控细胞周期,进而促进肿瘤的进展.
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编辑人员丨3周前
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基于网络药理学方法、分子对接技术及动物实验验证探讨通塞颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期的作用机制
编辑人员丨3周前
目的:基于网络药理学方法、分子对接技术和动物实验验证探讨通塞颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)的作用机制.方法:①预测分析.通过中药系统药理学分析平台筛选通塞颗粒的活性成分及其对应靶点;利用人类基因(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据系统(OMIM)等数据库检索AECOPD疾病基因;绘制韦恩图并获取药物-疾病共同靶点;构建通塞颗粒活性成分-靶点网络图和蛋白质相互作用网络图,根据网络关系筛选核心靶点;借助R语言软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用AutoDockTool 1.5.6 软件对通塞颗粒关键活性成分和核心靶点进行分子对接.②实验验证.随机将 50 只SD大鼠分为对照组、模型组、中药组、西药组、联合组各 10 只.除对照组外,其余各组均构建AECOPD大鼠模型,并于急性加重前 2 d及其后 4 d予药物灌胃治疗.治疗结束后检测各组大鼠的肺功能指标[0.3 s用力呼气容积(FEV0.3)、用力肺活量(FVC)、0.3 s用力呼气容积与用力肺活量的比值(FEV0.3/FVC)、呼气流量峰值(PEF)],检测血清肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-17含量,通过苏木精-伊红染色法(HE)观察气道与肺组织的病理改变,采用免疫印迹法和酶联免疫吸附测定法初步验证网络药理学的预测结果.结果:通塞颗粒治疗AECOPD的关键活性成分为槲皮素、芹黄素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇,主要作用于肿瘤抑制蛋白 53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)等核心靶点.GO富集分析和KEGG通路富集分析结果表明,通塞颗粒治疗AECOPD与TNF、IL-17 等信号通路干预氧化应激、减少细胞凋亡、抑制炎症反应有关.分子对接结果显示,通塞颗粒的关键活性成分与治疗AECOPD的核心靶点均有较好的结合活性.动物实验研究结果显示,模型组FVC、FEV0.3、FEV0.3/FVC、PEF值均较对照组降低(P<0.05).中药组、西药组以及联合组的FVC、FEV0.3、PEF值均较模型组升高(P<0.05);联合组FEV0.3/FVC值较模型组升高(P<0.05).中药组FVC、FEV0.3、FEV0.3/FVC、PEF值与西药组比较,差异均无统计学意义(P>0.05).联合组 FVC、PEF值均较中药组及西药组升高(P<0.05);联合组 FEV0.3 较西药组升高(P<0.05).模型组血清TNF-α、IL-17 含量均高于对照组(P<0.05);中药组、西药组及联合组的TNF-α、IL-17 含量均低于模型组(P<0.05);联合组血清TNF-α、IL-17 含量均低于中药组、西药组(P<0.05).模型组肺组织磷酸化P65/非磷酸化P65、磷酸化AKT/非磷酸化AKT、磷酸化MAPK1/3/非磷酸化MAPK1/3 和非磷酸化TP53/GAPDH蛋白表达含量均高于对照组(P<0.05);中药组、西药组以及联合组上述蛋白表达含量均低于模型组(P<0.05);联合组上述蛋白表达含量均低于中药组、西药组(P<0.05).结论:通塞颗粒治疗AECOPD具有多成分、多靶点、多通路、整体调节的作用特点,为后续深入研究提供了数据支持.
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编辑人员丨3周前
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基于黄芩汤治疗结直肠癌作用机制的网络药理学和分子对接分析
编辑人员丨2024/3/16
目的:通过网络药理学和分子对接技术分析黄芩汤治疗结直肠癌(CRC)的潜在作用靶点,阐明其相关分子机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)构建黄芩汤活性成分和作用靶点数据集,通过GeneCards、人类在线孟德尔遗传(OMIM)、药物遗传学和药物基因组学知识库(PharmGKB)等数据库构建CRC疾病相关靶点数据集.利用R软件、Cytoscape软件和STRING数据库构建药物-疾病靶点交集、黄芩汤中药复方调控网络和蛋白-蛋白互作(PPI)网络.利用R软件和Metascape平台进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock和PyMol软件进行分子对接验证,评估配受体结合情况.结果:筛选黄芩汤有效活性成分136个,黄芩汤治疗CRC的潜在靶点242个,核心靶点18个,基于信号通路分析获得CRC密切相关核心关键靶点5个,分别为蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、原癌基因FOS、肿瘤蛋白P53(TP53)和原癌基因MYC.GO功能富集分析,主要参与多种细胞应激反应的生物过程.KEGG信号通路富集分析,潜在靶点在癌症通路高度富集;进一步对CRC核心靶点进行KEGG信号通路富集分析,主要涉及内分泌抵抗、细胞凋亡和表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)抵抗等通路.分子对接验证,黄芩汤活性成分槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮和柚皮素与AKT1、MAPK3、FOS、TP53及MYC均对接稳定,其中槲皮素与AKT1结合性最好.结论:黄芩汤活性成分可多靶点和多通路治疗CRC,核心配受体槲皮素和AKT1可能通过调控磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路影响细胞增殖、分化和凋亡进程,发挥治疗CRC作用.
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编辑人员丨2024/3/16
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基于UPLC-Q-TOF-MS的参芪扶正注射液主要成分鉴定及其治疗三阴性乳腺癌的网络药理学研究
编辑人员丨2024/3/16
目的 应用超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱联用(UPLC-Q-TOF-MS)技术和网络药理学方法,鉴定参芪扶正注射液的主要成分,探究其治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的作用机制,为其药效物质基础研究提供依据.方法 ①参芪扶正注射液主要成分鉴定:采用UPLC-Q-TOF-MS技术,结合天然产物高分辨质谱数据库及相关文献,明确参芪扶正注射液的主要成分.②网络药理学研究:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中草药化合物蛋白质靶标数据库(HIT)、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、化合物靶点预测平台(Swiss Target Prediction)、本草组鉴数据库(HERB)获取参芪扶正注射液主要成分的潜在靶点,利用人类基因综合数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、治疗靶点数据库(TTD)获得TNBC疾病潜在靶点,二者相结合得到参芪扶正注射液治疗TNBC的潜在靶点;运用蛋白互作关系数据库(STRING)平台、Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白互作网络图并进行网络拓扑分析,获得参芪扶正注射液治疗TNBC的关键靶点;运用R语言进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.③动物实验验证:制备异种移植瘤乳腺癌小鼠模型,分为模型组与参芪扶正注射液低、中、高剂量(20、40、60 mL/kg)组,干预4周后取肿瘤组织,运用Western blot方法检测肿瘤组织中磷酸化磷脂肌醇3激酶(p-PI3K)、磷脂肌醇3激酶(PI3K)、P-糖蛋白(P-gp)、乳腺癌耐药蛋白(ABCG2)表达情况,并对预测潜在靶点进行实验验证.结果 ①参芪扶正注射液的主要成分为党参炔苷、鸟苷、毛蕊异黄酮苷、壬二酸、黄芪甲苷、美迪紫檀苷等.②网络药理学研究结果显示,参芪扶正注射液的主要成分主要作用于肿瘤蛋白p53(TP53)、白介素-2(IL-2)、白介素-6(IL-6)、白介素-10(IL-10)、己糖激酶2(HK2)、缺氧诱导因子1亚基α(HIF1A)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶9(CASP9)、ABCG2、ATP结合盒转运体B1(ABCB1)、原癌基因(MYC)等关键靶点,调控磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、T细胞受体等信号通路.③动物实验验证结果显示,参芪扶正注射液降低了实验动物肿瘤组织中p-PI3K水平,抑制了P-gp和ABCG2的表达.结论 参芪扶正注射液中的主要成分为党参炔苷、鸟苷、毛蕊异黄酮苷、壬二酸、黄芪甲苷、美迪紫檀苷等,其抗TNBC的作用机制与其通过调控PI3K信号通路和调节耐药相关蛋白表达有关.
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编辑人员丨2024/3/16
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王浆酸对人结肠癌SW620细胞增殖的抑制作用及其网络药理学分析
编辑人员丨2024/3/16
目的:基于网络药理学探讨王浆酸(10-HDA)对人结肠癌SW620细胞增殖和迁移的影响,阐明其相关分子机制.方法:利用中药系统药理学(TMSCP)数据库和中医药综合数据库(TCMID)以关键词"蜂王浆"进行检索得到 10-HDA等活性成分及对应靶点,采用Swiss Target Prediction数据库预测小分子靶点.采用GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库以关键词"Colon Cancer"获得靶点,利用String数据库和Cytoscape 3.8.0 软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,筛选核心靶点;利用Metascape数据库对基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集分析,筛选特有成分10-HDA进行体外活性实验.将生长状态良好的人结肠癌SW620细胞分为对照组和不同剂量(1、5、10、15和20 mmol·L-1)10-HDA组,采用MTT法检测各组细胞活性并计算细胞存活率.SW620细胞分为对照组、低剂量(5 mmol·L-1)10-HDA 组、中 剂 量(10 mmol·L-1)10-HDA 组 和 高 剂 量(15 mmol·L-1)10-HDA 组,Hoechst33342染色法观察各组细胞形态表现,细胞划痕实验检测各组细胞划痕愈合率,流式细胞术检测各组不同细胞周期细胞百分率,生化法检测各组细胞中总抗氧化能力(T-AOC)和超氧化物歧化酶(SOD)活性,Western blotting法检测各组细胞中B细胞淋巴瘤 2(Bcl-2)、Bcl-2 相关X蛋白(Bax)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶 3(Caspase-3)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶 9(Caspase-9)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、β-连环蛋白(β-catenin)和细胞周期蛋白D1(CyclinD1)蛋白表达水平.结果:TCMSP数据库筛选得到蜂王浆6种活性成分,10-HDA治疗结肠癌核心靶点28个.GO功能富集分析主要涉及细胞增殖和细胞凋亡等信号通路;KEGG信号通路富集分析涉及细胞周期、前列腺癌、细胞衰老和p53等信号通路,GSK3β/β-catenin信号通路与细胞周期有密切关联.与对照组比较,5、10、15和20 mmol·L-1 10-HDA组细胞存活率呈剂量依赖性降低(P<0.05或P<0.01).与对照组比较,不同剂量10-HDA组细胞中凋亡细胞数明显增多,细胞划痕愈合率明显降低(P<0.05 或P<0.01),中和高剂量 10-HDA组细胞中S期细胞百分率明显升高(P<0.05 或P<0.01),不同剂量 10-HDA组细胞中T-AOC和SOD活性明显降低(P<0.05或P<0.01).与对照组比较,低剂量10-HDA组细胞中Bcl-2蛋白表达水平明显降低(P<0.01),GSK3β蛋白表达水平明显升高(P<0.05);与对照组比较,中和高剂量 10-HDA组细胞中 Bax、Caspase-3、Caspase-9 和GSK3β蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01),Bcl-2、β-catenin和CyclinD1蛋白表达水平明显降低(P<0.01).结论:10-HDA可明显抑制结肠癌细胞增殖和迁移,并可促进结肠癌细胞的凋亡和氧化水平,其作用机制可能与激活GSK3β/β-catenin信号通路有关.
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编辑人员丨2024/3/16
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恶性肺小结节371例的临床和分子病理学特征
编辑人员丨2024/3/16
目的 总结恶性肺小结节的临床和分子病理学特征,提高对该疾病的认识.方法 以2018年3月至2021年12月于江苏省中医院心胸外科行肺小结节手术切除治疗且病理证实为恶性的患者为研究对象.回顾性分析其临床资料和手术标本分子病理学特征.结果 共纳入患者371例,原位癌39例,微浸润腺癌164例,浸润腺癌168例;女性69.8%,男性30.2%,女性占多数;87.6%患者不吸烟;右肺上叶的恶性结节最多(37.5%),其次为左肺下叶(18.6%).不同病理类型比较,原位癌、微浸润腺癌和浸润腺癌患者的年龄分别为(54.1±10.9)、(52.2±12.6)和(59.1±9.9)岁(F=16.05,P<0.01),吸烟率分别为 10.3%、3.7%和 21.4%(x2=24.31,P<0.01),瘤体直径中位值分别为0.55、0.60、0.80cm(H=76.13,P<0.01),均以浸润腺癌最高,差异均有统计学意义.浸润腺癌表皮生长因子受体(EGFR)的21外显子、肿瘤抑制蛋白p53(TP53)的突变频率高于原位癌和微浸润腺癌(P<0.05),而人类表皮生长因子受体2(HER2)的外显子20ins、丝裂原活化蛋白激酶(MAP2K1)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(BRAF)的突变频率低于原位癌和微浸润腺癌,差异有统计学意义(P<0.05).结论 具有恶性肺结节的患者,可能有下列特性:女性、不吸烟、位于右肺上叶多见.三种病理类型的恶性结节中,年龄、吸烟率、瘤体直径和驱动基因突变频率存在差异.
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编辑人员丨2024/3/16
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基于网络药理学方法探讨黄芪治疗骨骼肌减少症的作用机制
编辑人员丨2024/2/3
目的:使用网络药理学方法分析黄芪治疗骨骼肌减少症的作用机制.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选黄芪的活性成分并预测其作用靶点;筛选GEO与人类基因数据库(the human gene data-base,GeneCards)中有关骨骼肌减少症的相关基因并进行合并;使用STRING在线数据库将疾病与药物交集靶点进行蛋白相互作用分析,并使用Cytoscape 3.7.2软件对蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interac-tions,PPI)进行拓扑学分析,确定核心靶点;使用Cytoscape软件构建"药物-活性成分-靶点-疾病"网络,使用AutoDockTools等软件对药物关键分子与疾病关键蛋白进行分子对接验证;最后利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)分析,探究黄芪治疗骨骼肌减少症的生物功能,通过京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析探究黄芪治疗骨骼肌减少症的主要信号通路.结果:共得到黄芪有效活性成分作用靶点155个,骨骼肌减少症相关基因靶点1057个,药物-疾病交集靶基因36个,主要包括Akt1、p53、VEGFA、TNF、ESR1等;"药物-活性成分-靶点-疾病"调控网络显示槲皮素、华良姜素、联苯双酯、7-O-methylisomucronulatol、异鼠李素等药物活性成分在治疗骨骼肌减少症中发挥作用;分子对接验证实现了5种主要活性成分与5种关键靶点蛋白的对接,结果发现其均具有较强的结合活性;GO分析结果显示,黄芪治疗骨骼肌减少症主要与调控炎症反应及凋亡过程的正调控、细胞对缺氧的反应、细胞衰老等生物学过程有关,并影响蛋白质结合、转运活性、过氧化物酶体增殖物激活受体结合、肌动蛋白结合、生长因子活性、蛋白磷酸酶抑制剂活性等分子功能;KEGG分析显示靶点基因主要富集在癌症、肿瘤坏死因子、低氧诱导因子-1、细胞凋亡等通路.结论:黄芪可能通过同时调控多个靶点基因及相关信号通路,发挥诱导细胞衰老和凋亡、改善局部微循环、降低细胞外基质降解速度、减轻慢性炎症及氧化应激损伤等作用,以延缓骨骼肌萎缩.
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编辑人员丨2024/2/3