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甲基化蛋白7B抗体在成人急性髓系白血病中的表达及临床意义
编辑人员丨4天前
目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)数据分析甲基化蛋白7B抗体(METTL7B)在成人急性髓系白血病(AML)中的差异表达及临床意义,预测其在AML中可能的作用机制.方法 采用在线生物信息学数据库整合TCGA和GEO数据分析METTL7B在成人AML组织中的差异表达与生存预后,以及其与药物反应和免疫细胞浸润的相关关系.对METTL7B基因进行功能富集分析.结果 与健康成人组织相比,成人AML组织中METTL7B表达水平升高(P<0.05).METTL7B高表达与成人AML患者较短的总生存期和无事件生存期呈正相关(P<0.05).METTL7B高表达与组蛋白脱乙酰基酶1(HDAC1)抑制剂耐药和AML中的单核细胞/巨噬细胞(尤其是M2巨噬细胞)免疫浸润呈正相关(P<0.05).METTL7B基因参与调控巨噬细胞活化生物过程,参与巨噬细胞标记和调控肿瘤微环境中的免疫细胞与microRNAs相互作用.结论 METTL7B表达在成人AML组织中显著上调.METTL7B高表达与成人AML患者的不良预后相关,可作为AML新的预后生物标志物.METTL7B基因可能通过介导HDAC1抑制剂耐药和M2巨噬细胞免疫浸润参与AML疾病进展.
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编辑人员丨4天前
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肠道黏液层中MUC2、sIgA在婴儿食物过敏中的动态变化及应用价值
编辑人员丨4天前
目的 动态监测分析食物过敏婴儿临床治疗过程中粪便黏蛋白2(MUC2)及分泌型免疫球蛋白A(sIgA)的变化情况,探究其与食物过敏的关系及应用价值.方法 选择2022年7月至2023年6月门诊就诊的食物过敏婴儿52例为食物过敏组,同期选取非过敏性疾病婴儿52例作为对照组,比较两组患儿粪便MUC2、sIgA水平的差异.结果 食物过敏组男23例、女29例,对照组男女各26例,两组患儿在年龄、分娩方式、喂养方式、辅食添加、过敏性疾病家族史的差异均无统计学意义.食物过敏组中粪便MUC2及sIgA水平均高于对照组[37.81±14.91 μg/mL比25.33±14.29 μg/mL;182.4(150.2~202.7)μg/mL比147.7(131.4~157.9)μg/mL],差异具有统计学意义(P<0.001).在随访第2、4周时,食物过敏组患儿的粪便MUC2水平逐渐下降,但组间比较显示差异无统计学意义(P>0.05);而粪便sIgA水平逐渐升高,组间比较提示差异有统计学意义(P<0.05).对粪便MUC2、sIgA进行二元logistic回归分析及ROC曲线分析,粪便MUC2及sIgA的ROC曲线下面积均在0.7以上(P<0.001),两者联合诊断可提高诊断的特异度.结论 粪便MUC2及sIgA水平在两组患儿之间均存在差异,随着食物过敏患儿临床症状的好转,粪便MUC2水平有下降趋势、sIgA水平逐渐升高,两者可能作为诊断食物过敏的潜在生物标志物.
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编辑人员丨4天前
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基于生物信息学的CD39对肺腺癌免疫微环境及其免疫治疗的影响分析
编辑人员丨4天前
目的 采用生物信息学方法探讨CD39基因在肺腺癌组织中的表达情况,并分析CD39与肺腺癌免疫微环境及免疫治疗响应的关系.方法 通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析CD39在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达差异.采用基因集富集分析(GSEA)研究CD39可能富集的免疫相关通路;通过肿瘤免疫数据库(TIMER)分析肺腺癌患者中CD39基因表达情况与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;同时分析CD39和其他免疫检查点基因PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1的相关性,采用药物敏感性基因组学数据库(GDSC)和肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)数据库,预测CD39基因表达与化疗药物敏感性以及免疫治疗的响应.结果 CD39在肺腺癌组织中的表达低于在正常组织中的表达,CD39富集了免疫相关通路如炎症反应、干扰素α反应、干扰素γ反应.TIMER数据库均显示在肺腺癌组织中,CD39的表达与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞以及树突状细胞呈正相关性.同时CD39与其他的免疫检查点PD-1、PD-L1、CTLA-4、IDO1均呈一定的正相关性,化疗敏感性显示在肺腺癌组织中,对于博来霉素、顺铂、多西他赛、长春花碱等化疗药物,高表达CD39组对其敏感.但对于免疫治疗,其响应率却低于CD39低表达组.结论 CD39在肺腺癌组织中低表达,能激活免疫相关通路,对免疫治疗响应率高,可作为肺腺癌新型分子标志物.
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编辑人员丨4天前
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替雷利珠单抗在肺癌治疗的研究进展
编辑人员丨4天前
肺癌是发病率和死亡率很高的恶性肿瘤,严重威胁人类健康,给社会和患者家庭带来重大的经济负担.免疫治疗在肺癌领域进展最快,已成为肺癌治疗重要选择之一,替雷利珠单抗是我国自主研发的程序性死亡受体1抑制剂创新药,具有独特的结构和作用机制,其联合化疗一线治疗晚期非小细胞肺癌以及单药二线或三线治疗晚期非小细胞肺癌,替雷利珠单抗均表现出良好的疗效和安全性.
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编辑人员丨4天前
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细胞焦亡及其相关因子caspase-1和IL-1β与非小细胞肺癌
编辑人员丨4天前
细胞焦亡是一种与炎症相关的程序性细胞死亡过程,其经半胱天冬氨酸蛋白酶-1(caspase-1)与促炎因子白细胞介素-1β(interleukin 1β,IL-1β)介导后发生,从而发挥促进或抑制非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)发生、发展的双重作用.一方面,焦亡相关因子通过构建促肿瘤微环境助力NSCLC进展;另一方面,caspase-1和IL-1β通过调控经典炎性细胞焦亡途径延缓NSCLC进展.在肺肿瘤治疗方面,尽管部分化学治疗、免疫治疗、靶向治疗及中草药治疗通过细胞焦亡分子调控机制增强了药物敏感性,使癌细胞的进展得到延缓,但同时周围正常组织也因细胞焦亡产生的不良反应而受到伤害.Caspase-1、IL-1β作为新的、独立的生物学标志物可通过诱导细胞焦亡的发生而参与NSCLC的发生,并能在NSCLC治疗中发挥作用,可为NSCLC靶向治疗提供新的理论依据和策略.
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编辑人员丨4天前
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发育不良和歪头病对变态末期棘胸蛙皮肤菌群的影响
编辑人员丨4天前
实验基于高通量测序技术,以健康(CTL组)、发育不良(DD组)和患歪头病(TD组)的棘胸蛙(Quasipaa spinosa)为研究对象,系统地探索宿主健康状态与皮肤微生物菌群组成、多样性及功能之间的潜在关系.所有样本经测序、质控及聚类获得2997条扩增子序列变体(ASVs),注释32个门,76个纲,167个目,259个科和402个属,其中变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidota)为棘胸蛙皮肤主要优势菌门(>1%),但丰度受宿主健康状态的影响.在属水平上筛选获得50个菌群标志物,其中23个(如乳杆菌(Lactobacillus)、德沃斯氏(Devosia)、希瓦氏菌(Shewanella)和Luteolibacter)在CTL组中相对丰度较高,提示棘胸蛙的健康状态;19个(如短稳杆菌(Empedobacter)、芽孢杆菌(Bacillus)和短螺旋体(Brevinema))在DD组中相对丰度较高,提示棘胸蛙发育不良的病症;8个(如伊丽莎白菌(Elizabethkingia)、柠檬酸杆菌(Citrobacter)和不动杆菌(Acinetobacter))在TD组中相对丰度较高,提示棘胸蛙歪头病的病症.多样性分析表明,TD组的多样性和均一度与CTL组和DD组相比显著降低,微生物菌群组成也表现出明显分离.功能预测表明,CTL组和TD组皮肤微生物菌群之间功能差异主要富集在新陈代谢相关通路.总之,该项研究揭示不同健康状态下棘胸蛙皮肤微生物菌群的组成和变化,突出共生微生物菌群在两栖动物健康养殖和疾病预防中的潜在应用.
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编辑人员丨4天前
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子宫内膜异位症相关生物标志物研究进展
编辑人员丨4天前
子宫内膜异位症(EMs)其特征是子宫腔外存在子宫内膜样组织,是育龄期妇女常见的一种慢性良性易复发疾病,全球发病率约为 10%.由于该病是一种多因素疾病,发病机制未阐明,目前诊断金标准仍为腹腔镜病理检查,临床上缺少敏感且特异的生物标志物,寻找准确可靠、适用于临床的无创生物标志物是当前研究的热点和重点.本文对与EMs相关的糖类蛋白、转录组学、自身抗体生物标志物中最重要、最新颖的研究结果进行总结,为早期诊断、靶向治疗提供新的策略.
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编辑人员丨4天前
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肺动脉高压相关线粒体自噬生物标志物及其作用的分析与验证
编辑人员丨4天前
目的:通过生物信息学方法筛选肺动脉高压(PAH)相关线粒体自噬差异表达基因,为进一步研究线粒体自噬提供新依据.方法:从高通量基因表达数据库(GEO)下载PAH相关数据集,分为测试集和验证集,从分子签名数据库(MSigDB)和通路统一数据库下载线粒体自噬相关基因,筛选线粒体自噬相关的PAH差异表达基因并进行基因本体论(GO)注释分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、蛋白质—蛋白质互作分析等.通过验证集验证生物标记物,将具有显著性差异且差异趋势一致的关键基因进行ROC验证,并收集先天性心脏病(CHD)相关PAH(PAH-CHD)及CHD共32例患儿外周血进行关键基因实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)表达验证.结果:收集到数据集GSE113439、GSE15197、GSE117261作为测试集,GSE38267作为验证集,共得到11个PAH相关线粒体自噬差异表达基因,这些基因主要富集在线粒体自噬—动物、神经退行性疾病—多种疾病通路、自噬—动物、志贺氏菌病、粘附连接、胞吞、帕金森病等通路中,其中5个关键基因(GABARA-PL2,OPTN,RNF41,SRC,UBB)在合并数据集和验证集PAH组和正常组(Normal组)存在显著性差异且差异趋势一致.GAB-ARAPL2,OPTN,UBBmRNA在PAH-CHD外周血的表达与预测趋势一致,而GABARAPL2mRNA在PAH-CHD组外周血中表达显著升高(P<0.05).结论:GABARAPL2可能在PAH相关线粒体自噬中起调控作用,具体的机制仍需要进一步的体内和体外验证.
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编辑人员丨4天前
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抗苗勒管激素在生殖内分泌领域的研究进展
编辑人员丨4天前
抗苗勒管激素(AMH)是两性生殖腺发育必不可少的关键激素.近年研究发现,AMH是评估卵泡数量的良好生物学标志物,但不反映卵母细胞质量或女性受孕机会,低水平的AMH可能提示生育窗口期的缩短,但不能预测生育能力.血清AMH水平有助于鉴别诊断非梗阻性无精子症(NOA)与梗阻性无精子症(OA).另外,由于AMH分泌的波动性及个体差异性,AMH水平的解读必须在内源性内分泌环境的背景下进行.本文就AMH在生殖内分泌领域的研究进展进行综述.
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编辑人员丨4天前
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RBMX在肝细胞癌中的临床意义及其对免疫微环境的影响
编辑人员丨4天前
目的:利用肿瘤相关数据库探讨RNA结合基序蛋白X连锁(RBMX)在肝细胞癌(HCC)中的表达及临床意义,同时探讨其与免疫微环境(TIME)的关系.方法:使用GEO数据库和TCGA数据库分析多个HCC数据集中RBMX mRNA的表达情况,分析其与临床参数的关系,用ROC曲线评价RBMX在HCC诊断模型中的价值.利用Kaplan-Meier生存曲线分析RBMX表达水平与HCC患者生存预后的相关性.利用CIBERSORT、ssGSEA、TIMER数据库分析RBMX表达与免疫指标的相关性;并利用TISCH数据库分析RBMX在不同HCC单细胞数据集中免疫细胞的富集情况.利用免疫组织化学(IHC)验证RBMX在23例HCC癌组织与癌旁组织的表达情况.通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证RBMX在HCC细胞系中的表达.采用CCK-8法、EdU染色实验检测细胞的增殖能力,Transwell实验检测细胞迁移.结果:多个数据集均显示RBMX在HCC组织中表达上调(P<0.001),临床分级越高、淋巴结转移程度越高,表达水平越高(P<0.001).RBMX对HCC具有显著的诊断价值(AUC=0.936),RBMX与HCC较短的总生存时间呈正相关关系(P<0.001).RBMX高表达与M0巨噬细胞、Treg细胞、Tprolif浸润密切相关(P<0.05).23例HCC组织标本及5个HCC细胞系表明RBMX在HCC中的异常上调.敲低RB-MX可抑制HCC细胞的增殖与迁移.结论:RBMX可能是一种与免疫相关的HCC预后生物标志物.
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编辑人员丨4天前