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一例德朗热综合征患儿的致病基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:对1例疑诊德朗热综合征(Cornelia de Lange syndrome,CdLS)的患儿进行致病基因变异检测,明确其发病原因。方法:应用高通量捕获测序对CdLS相关致病基因(NIPBL、SMC1A、SMC3、RAD21和HDAC8)进行测序,用Sanger测序验证测序结果以及致病基因的家系分析。结果:患儿 NIPBL基因存在c.6109-1G>A杂合剪接变异,Sanger测序验证结果表明患儿父母均未携带此变异,提示为新发变异,该变异未在HGMD及ExAC数据库收录。根据Human Splicing Finder预测剪接软件,预测该剪接变异将改变 NIPBL基因剪接位点,为致病性变异。未发现SMC1A、SMC3、RAD21和HDAC8基因致病性变异。 结论:NIPBL基因c.6109-1G>A剪接变异可能是该例患儿的发病原因,新变异的检出丰富了 NIPBL基因变异谱。
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编辑人员丨1周前
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儿童NIPBL-ETV6融合基因阳性急性未分化白血病1例报告并文献复习
编辑人员丨1周前
儿童NIPBL-ETV6融合基因阳性急性未分化白血病(AUL)较为罕见,现对1例NIPBL-ETV6融合基因阳性AUL患儿的临床资料进行回顾性分析,并复习相关文献,旨在为该类疾病细胞遗传学异质性提供新的信息,并为其治疗方案提供相关的参考依据。
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编辑人员丨1周前
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NIPBL基因剪接变异致德朗热综合征1型胎儿的产前诊断及遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:分析一例德朗热综合征1型胎儿的遗传学病因。方法:收集胎儿及其父母的临床资料,采集羊水及父母的外周血样,提取基因组DNA,通过全基因组低深度重测序、全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)及Sanger测序筛查 NIPBL基因的变异位点,参考美国医学遗传学与基因组学学会指南判断变异的致病性,利用minigene技术分析变异对mRNA的影响。 结果:测序结果提示胎儿 NIPBL基因的内含子上存在c.5808+5G>A杂合变异,预测可能影响mRNA剪接,胎儿父母未检测到相同的变异。上述变异在ExAC、1000G、dbSNP等数据库中均未见收录,综合分析判断其为有害变异。minigene实验结果证实该变异会影响mRNA剪接,导致第31外显子的跳跃。 结论:确诊了一例德朗热综合征1型胎儿。minigene实验可以在体外验证WES检测所发现的剪接变异,可为判断这类变异的致病性提供更多的证据。
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编辑人员丨1周前
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新生儿德朗热综合征1例
编辑人员丨1周前
本文报道1例新生儿德朗热综合征,患儿宫内发育迟缓,生后发现连眉、耳廓畸形、无外耳道,短鼻、鼻孔前倾,长人中,唇薄而红、小头、小手等多发畸形,全外显子检测提示NIPBL基因c.7373-7374del移码变异,家长放弃治疗后于生后1个月死亡。
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编辑人员丨1周前
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NIPBL基因新发变异致Cornelia de Lange综合征一例
编辑人员丨1周前
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编辑人员丨1周前
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一例Ⅰ型Cornelia de Lange综合征胎儿的临床表型及基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:对1例疑诊为Cornelia de Lange综合征的引产儿及其亲代进行基因检测,为遗传咨询和产前诊断提供依据。方法:详细询问妊娠史及家族史,结合孕期影像学检查及引产儿表型做出临床诊断。收集引产儿组织及其亲代的静脉血样,提取基因组DNA,进行全外显子组测序分析,筛查与表型相关的变异位点,并通过Sanger测序进行验证。结果:孕期超声提示胎儿前臂及手形态异常、小脑蚓部发育不良、下颌偏小、双肾实质回声增强,引产后可见上肢及面部畸形。全外显子组测序提示胎儿携带 NIPBL基因c.2118delG(p.Lys706fs)杂合移码变异,其父母未检出相同变异。 结论:NIPBL基因c.2118delG杂合移码变异可能是胎儿的致病原因。上述结果可为家系遗传咨询及指导再生育提供依据。
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编辑人员丨1周前
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Cornelia de Lange综合征患儿3例的基因型及表型分析
编辑人员丨1周前
目的:对3例Cornelia de Lange综合征(CdLS)患儿的临床表型及基因检测结果进行分析,明确其致病原因。方法:选取2020年3月12日、8月14日、12月5日于甘肃省妇幼保健院医学遗传中心就诊的3例CdLS患儿为研究对象。收集患儿及其父母的临床资料,采集外周血样进行家系高通量测序分析。结果:3例患儿的主要临床表现包括发育迟缓、智力低下、特殊面容和其他伴随症状。根据国际诊断共识标准,3例患儿被拟诊为CdLS。通过家系全外显子组测序及生物信息学分析,确诊CdLS。患儿1携带 NIPBL基因c.5567_5569delGAAinsTAT错义变异,患儿2携带 SMC1A基因c.607A>G错义变异,患儿3携带 HDAC8基因c.628+1G>A剪接变异。3例患儿均为新发变异。 结论:3例患儿均确诊CdLS,并发现了致病基因变异位点,其中 NIPBL基因c.5567_5569delGAAinsTAT及 HDAC8基因c.628+1G>A变异位点既往未见报道,丰富了CdLS的变异谱。
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编辑人员丨1周前
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一例 ASXL3基因变异伴孤独症特征的Bainbridge-Ropers综合征患儿的临床及遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:分析1例表现为重度精神发育迟滞、语言运动发育迟缓伴孤独症特征患儿的临床表型及遗传学特点。方法:对患儿进行高通量捕获测序分析,对疑似致病变异进行Sanger测序验证和生物信息学分析。结果:患儿 ASXL3基因存在第11外显子c.1421_1422insTGAATTTTCTGAGGAGG-CTGAAAGT(p.Leu483*)杂合变异,其父母均未携带相同变异,提示为新发变异。 结论:ASXL3基因第11外显子c.1421_1422insTGAATTTTCTGAGGAGGCTGAAAGT(p.Leu483*)变异可能是该例Bainbridge-Ropers综合征患儿的遗传学病因,新变异的检出丰富了 NIPBL基因变异谱。
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编辑人员丨1周前
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NIPBL基因变异致Cornelia de Lange综合征1型胎儿1例
编辑人员丨1周前
孕妇31岁,G2P0,前次不良孕史(孕妇于孕10w超声未见胎心,引产后流产物未作遗传相关检测)。该夫妇表型均为正常,且否认近亲婚配及遗传病家族史。本次妊娠于孕21 +4w系统超声提示:胎儿颅骨周围皮肤略增厚、鼻根部及额头前方皮肤增厚,鼻骨未显示、上唇部明显增厚前突、小下颌,胸骨位置略内陷,心脏室间隔缺损、右室壁增厚、心包积液,左手无名指缺如且食指及中指第三指骨并连未分离,胎儿胆囊稍增大,胎儿颈后皮褶厚度(nuchal fold,NF)增厚等(见图1)。中孕期行羊水穿刺术,染色体核型分析及染色体拷贝数变异检查(copy number variation,CNV)均未见明显异常。但由于胎儿畸形和预后不确定,胎儿父母于孕24w选择终止妊娠,引产胎儿主要表现为面容异常(如头皮大理石样皮肤、头皮厚、眉毛浓密、长人中、鼻短、上唇前突、下颌后缩、低位后旋耳、)颈蹼和手指异常(如并指、少指、掌裂)等(见图2)。对该夫妇进行遗传咨询,并签署家系全外显子测序知情同意书。本研究符合《世界医学协会赫尔辛基宣言》。
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编辑人员丨1周前
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一例重型Cornelia de Lange综合征患者的 NIPBL基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:分析1例重型Cornelia de Lange综合征(Cornelia de Lange syndrome,CdLS)患儿的 NIPBL基因变异,明确其遗传学病因。 方法:提取患儿及其父母外周血中DNA物质,应用全外显子基因组测序法检测相关基因变异,应用Sanger测序法验证变异。对可疑变异进行生物信息学预测。结果:经全外显子基因组测序分析并经Sanger测序验证,发现患儿 NIPBL基因第9外显子存在c.1507A>G(p. Lys503Glu)杂合错义变异,该变异为新发变异,且为未报道过的新变异。经PolyPhen-2、Mutation Taster、SIFT预测软件预测c.1507A>G(p. Lys503Glu)变异为可能有害变异,并经HomoloGene系统分析NIPBL蛋白第503位Lys在各种属间均高度保守,该位点氨基酸改变可导致编码的NIPBL原有蛋白功能发生障碍。而经过PubMed BLAST系统进一步分析发现该位点氨基酸的改变可通过影响Neuromodulin_N superfamily结构域的形成来导致NIPBL蛋白功能发生障碍的。 结论:NIPBL基因c.1507A>G(p. Lys503Glu)错义变异可能为该患儿罹患重型CdLS的致病原因,基因变异检测结果可以为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。
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编辑人员丨1周前