-
海马G蛋白偶联雌激素受体1参与癫痫调控的转录组学研究
编辑人员丨1天前
目的 本研究分别将野生型(WT)、Gper1敲低(Gper1-KD)大鼠海马组织进行转录组测序,探讨G蛋白偶联雌激素受体 1(G-protein coupled estrogen receptor 1,GPER1)影响癫痫发病可能的信号通路和分子机制.方法 海马组织进行RNA提取和cDNA文库构建,与NCBI数据库大鼠基因组及基因注释比对,通过FPKM值,筛选组别间差异表达基因(DEGs).将DEGs进行GO富集、KEGG富集分析,构建蛋白互作网络,利用RT-qPCR法对关键DEGs进行验证.结果 Gper1-KD 组与 WT 组相比,筛选(Fold change>2且FDR<0.01)后,检测到DEGs 2 253个,其中上调基因1 380个,下调基因873个;GO结果显示,DEGs主要分布在淋巴细胞趋化性、细胞分泌、巨噬细胞趋化性、中性粒细胞趋化性、血管生成正向调控等生物过程;KEGG结果显示,DEGs相关分子信号通路主要有癌症信号通路、PI3K-Akt通路、癌症蛋白聚糖相关信号通路、细胞黏附相关通路、MAPK信号通路等;RT-qPCR 结果表明,Mapk12、Pdpk1、Foxo3、Camk2d、Pik3cg 等基因表达水平差异具有显著性.结论 MAPK、TNF信号通路在GPER1影响癫痫发生中可能起关键作用,GABA能神经元和Pik3cg在GPER1影响癫痫易感性方面可能发挥重要作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
奥希替尼联合培美曲塞/铂类对表皮生长因子受体合并TP53基因突变的非小细胞肺癌疗效及预后分析
编辑人员丨1天前
目的 探究奥希替尼联合培美曲塞/铂类对 EGFR 合并 TP53 突变的非小细胞肺癌(NSCLC)疗效及预后分析.方法 选取中国人民解放军联勤保障部队第 904 医院在 2016 年 1 月至2022 年 6 月间诊治的 80 例表皮生长因子受体合并TP53 基因突变的NSCLC患者纳入本次研究,随机数字法分为对照组(40 例)和研究组(40 例).对照组行奥希替尼治疗,研究组行奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗治疗.对两组临床疗效、血清指标水平、用药安全性以及预后进行对比分析.结果 研究组总缓解率(ORR)和疾病控制率(DCR)均优于对照组(P<0.05).治疗后,两组细胞角蛋白 19 片段(CY-FRA21-1)、癌胚抗原(CEA)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05).治疗后,两组白细胞介素 4(IL-4)、血管内皮生长因子(VEGF)、细胞间黏附分子-1(ICAM-1)水平均低于治疗前(P<0.05),研究组低于对照组(P<0.05).两组不良反应差异无统计学意义(P>0.05).研究组随访 1 年后的生存率明显高于对照组(P<0.05).治疗后,两组生存质量测定表(EORTC QLQ-C30)评分高于治疗前(P<0.05),研究组高于对照组(P<0.05).结论 奥希替尼联合培美曲塞/铂类化疗方案用于EGFR合并TP53 基因突变的NSCLC的临床治疗,可有效发挥抗肿瘤效果,下调炎症水平,提升疗效,改善患者预后,且用药具有较高安全性,不会明显增加不良反应.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1天前
-
增强子RNA RASSF8-AS1在胃腺癌中的临床意义与分子机制
编辑人员丨1周前
目的 探究增强子RNA RASSF8-AS1在胃腺癌(STAD)中的表达和关键靶基因预测,分析RASSF8-AS1与临床病理特征、预后的关系,探索RASSF8-AS1在STAD发生发展中的作用机制.方法 在UCSC Xena数据库中下载33类肿瘤的表达数据、生存数据和临床数据.采用Kaplan-Meier生存分析和相关性分析确定关键eRNA及其调控基因为eRNA-靶基因对.使用R语言ggboxplot命令分析RASSF8-AS1表达与患者临床病理的相关性,利用GO和KEGG富集分析探索RASSF8-AS1在STAD中参与的信号途径.使用逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证RASSF8-AS1在正常和胃腺癌细胞系中的表达量.结果 RASSF8-AS1的表达水平与患者的年龄、临床分级、临床分期显著相关(c2=4.356、4.166、6.452,P均<0.05).RT-qPCR结果表明,与正常细胞相比,胃癌细胞中RASSF8-AS1和RASSF8的表达水平显著降低,差异有统计学意义(HR=0.044,95%CI:0.032~0.056,P<0.05).RASSF8-AS1高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,差异有统计学意义(P<0.05).GO分析结果表明,RASSF8-AS1参与了细胞外基质组织构建、细胞黏附、化学突触传递的调节、胶原代谢等多种生物过程.KEGG通路分析中,间质发展、细胞外基质组织、膜电位的调节等信号途径被富集.结论 RASSF8-AS1是胃癌中与生存相关的关键eRNA,可能成为胃癌患者早期诊断的潜在生物标志物和潜在的治疗靶点.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
腺苷A2B受体激活减轻脓毒症诱导的急性肺损伤及肺微血管内皮炎症损伤
编辑人员丨1周前
目的 分析腺苷A2B受体(A2BR)激活对脓毒症诱导的急性肺损伤(ALI)的影响并探讨其在肺微血管内皮炎症损伤中的调控作用.方法 (1)将24只SD大鼠随机分为假手术组(sham组)、ALI模型组(ALI组)、A2BR激动剂BAY60-6583干预组(ALI+BAY组)和A2BR抑制剂PSB1115干预组(ALI+PSB组),每组6只.制模后24 h处死大鼠取肺组织,光镜下行肺损伤评分(Smith评分),计算肺湿/干质量比值(W/D).Evans Blue染色法测定肺水清除率(AFC).酶联免疫吸附试验(ELISA)测定肺组织炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)的水平.(2)采用TNF-α诱导人肺微血管内皮细胞(HPMECs)损伤模型,设立对照组、TNF-α组、BAY组、PSB组、BAY+TNF-α组和PSB+TNF-α组,各组细胞培养24 h后采用异硫氰酸荧光素(FITC)-白蛋白(albumin)法检测HPMECs单层通透性,Werstern blot法检测IL-1β、细胞间黏附分子-1(ICAM-1)、血管内皮钙黏连蛋白(VE-cadherin)、促血管生成素(ANGPT)的表达水平.结果 与sham组比较,ALI组的Smith评分、肺W/D及肺组织TNF-α、IL-6、IL-1β水平均显著升高,AFC显著降低;与ALI组比较,ALI+BAY组的Smith评分、肺W/D及肺组织TNF-α、IL-6、IL-1β水平显著降低,AFC显著升高;而ALI+PSB组结果相反.TNF-α诱导HPMECs损伤模型中,与对照组比较,TNF-α组IL-1β、ICAM-1表达水平及HPMECs单层通透性升高,VE-cadherin、ANGPT表达水平降低.与TNF-α组比较,BAY+TNF-α组IL-1β、ICAM-1表达水平及HPMECs单层通透性降低,VE-cadherin、ANGPT表达水平升高,而PSB1115预处理可逆转上述现象.上述各组之间差异有统计学意义(均P<0.05).结论 腺苷A2BR激活可减轻脓毒症诱导的ALI,并通过减轻肺微血管内皮炎症、降低通透性、促进血管生成等途径起保护作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
针刺联合循经按摩治疗新生儿缺氧缺血性脑病恢复期临床研究
编辑人员丨1周前
目的:观察针刺联合循经按摩治疗新生儿缺氧缺血性脑病(NHIE)恢复期的疗效.方法:选取102例NHIE恢复期患儿作为研究对象,按照治疗方案不同分为针刺组、抚触按摩组、联合组,各34例.3组均给予常规康复治疗,在此基础上,针刺组给予针刺治疗,抚触按摩组给予循经按摩,联合组给予针刺联合循经按摩治疗.比较3组临床疗效及预后情况,比较3组治疗前后血液流变学指标[全血高切黏度、全血低切黏度、血浆黏度]、血清炎性因子[白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、可溶性细胞间黏附分子-1(sICAM-1)]、神经相关因子[Tau蛋白、生长激素(GH)、胰岛素生长因子-1(IGF-1)、金属蛋白酶-9(MMP-9)]、生长发育指标[智能发育(MDI)、运动发育(PDI)]值的变化.结果:联合组总有效率为94.12%,针刺组、抚触按摩组分别为76.47%、70.59%,针刺组、抚触按摩组与联合组比较,差异有统计学意义(P<0.05).治疗4周、8周后,3组血浆全血高切黏度、全血低切黏度、血浆黏度均较治疗前下降(P<0.05);治疗4周、8周后,联合组血浆全血高切黏度、全血低切黏度、血浆黏度均低于同一时间段的针刺组、抚触按摩组(P<0.05).治疗4周、8周后,3组血清IL-6、TNF-α、sICAM-1水平均较治疗前下降(P<0.05);治疗4周、8周后,联合组血清IL-6、TNF-α、sICAM-1水平均低于同一时间段的针刺组、抚触按摩组(P<0.05).治疗4周、8周后,3组血清Tau蛋白、MMP-9水平均较治疗前下降,血清GH、IGF-1水平均较治疗前上升(P<0.05);治疗4周、8周后,联合组血清Tau蛋白、MMP-9水平低于同一时间段的针刺组、抚触按摩组,血清GH、IGF-1水平高于同一时间段的针刺组、抚触按摩组(P<0.05).治疗 4周、8周后,3组MDI、PDI评分均较治疗前升高(P<0.05);治疗4周、8周后,联合组MDI、PDI评分均大于同一时间段的针刺组、抚触按摩组.随访6个月,Ridit检验显示,联合组预后情况优于针刺组、抚触按摩组(P<0.05);针刺组与抚触按摩组预后情况比较,差异无统计学意义(P>0.05).结论:针刺联合循经按摩疗效确切,可调节NHIE患儿血液流变情况,抑制炎症因子分泌,调节神经相关因子水平,有助于患儿智力及运动发育,预后良好.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
脓毒症相关性脑病差异基因以及发病机制的数据分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨脓毒症相关性脑病(sepsis-associated encephalopathy, SAE)的相关差异表达基因(differentially expressed gene, DEG)和信号转导途径。方法:基于基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)的脓毒症患者脑组织的基因组数据,采用基因本体(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,以及蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析,确定SAE的DEG。结果:DEG在免疫应答、炎症反应、凋亡过程的负调控、蛋白质水解等方面显著富集。通过PPI分析筛选出10个枢纽基因,包括固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1, SREBF1)、细胞因子信号转导抑制因子-3(suppressor of cytokine signaling 3, SOCS3)、封闭蛋白5(claudin 5, CLDN5)、免疫球蛋白结构域蛋白4(V-set and immunoglobulin domain containing 4, VSIG4)、DNA损伤诱导蛋白45β(growth arrest and DNA damage inducible protein 45β, GADD45β)、细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule 1, ICAM1)、血管生成素-2基因(angiopoietin 2, ANGPT2)、CD14、CD163、血栓反应蛋白1(thrombospondin 1, THBS1)。结论:通过生物信息学方法挖掘出与SAE相关的10个枢纽基因,这些基因和机体的免疫炎症相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
单细胞测序和数字PCR技术筛选单核细胞差异基因集对脓毒症早期诊断的临床意义
编辑人员丨1周前
目的:验证脓毒症中特异分化的单核细胞亚群,并筛选及构建用于早期诊断脓毒症的单核细胞差异基因集。方法:选择广东省人民医院2020年6月至2021年3月收治的脓毒症患者,提取外周血单个核细胞(PBMC),应用单细胞测序技术和拟时序分析对单核细胞差异亚群进行验证。利用生物信息学手段分析差异亚群中的基因表达,并筛选出差异基因用于初步构建候选差异基因集。利用数字聚合酶链反应(PCR)技术分别在脓毒症患者PBMC以及脓毒症人髓系白血病单核细胞株(THP-1)模型中对候选差异基因进行验证,并利用韦恩图构建最终的单核细胞差异基因集。使用基因表达数据库(GEO)对差异基因集进行外部数据验证。结果:①细胞注释及拟时序分析结果显示,NEAT1 +CD163 +单核细胞的分化明显区别于其他亚群,并在脓毒症早期就已经出现,是脓毒症病理过程中的特征亚群。②从NEAT1 +CD163 +单核细胞的基因表达中筛选出22个与脓毒症相关的差异基因,经过数字PCR进一步验证后,最终筛选出碱性亮氨酸拉链ATF样转录因子(BATF)、原癌基因JUNB、癌胚抗原相关细胞黏附分子4(CEACAM4)、第9号染色体上95开放阅读框(C9orf95)、G蛋白α亚基15(GNA15)、补体C3A受体1(C3AR1)、转录生长因子β1(TGFB1)、线粒体载体同源物1(MTCH1)8个基因,用于构建最终的单核细胞差异基因集。③外部验证结果显示,由于C9orf95基因在GEO数据库的GSE154918及GSE133822两个数据集中均无数据,因此在验证时将其排除。在GSE154918数据集,单核细胞差异基因集中BATF、JUNB、CEACAM4、GNA15、C3AR1、TGFB1、MTCH1的表达在脓毒症组均较健康对照组明显升高(log 2表达量:BATF为12.78±0.08比11.39±0.35,JUNB为16.88±0.07比16.04±0.03,CEACAM4为14.73±0.08比13.77±0.05,GNA15为13.16±0.06比12.30±0.04,C3AR1为14.62±0.13比12.87±0.05,TGFB1为16.95±0.05比16.57±0.36,MTCH1为14.80±0.02比14.61±0.15,均 P<0.05);在GSE133822数据集,基因集中BATF、CEACAM4、GNA15、C3AR1的表达在脓毒症组明显高于健康对照组(log 2表达量:BATF为8.66±0.16比7.92±0.14,CEACAM4为9.20±0.16比8.36±0.20,GNA15为10.66±0.18比10.13±0.16,C3AR1为11.49±0.27比10.48±0.16,均 P<0.05),而JUNB、TGFB1、MTCH1的表达在两组人群中差异无统计学意义。基因集差异分析(GSVA)显示,在GSE154918及GSE133822两个数据集中,脓毒症组单核细胞差异基因集的富集分数均显著高于健康对照组(GSE154918:0.38±0.04比-0.44±0.02,GSE133822:0.56±0.02比0.20±0.05,均 P<0.01)。受试者工作特征曲线(ROC曲线)分析显示,单核细胞差异基因集在GSE154918及GSE133822两个数据集中对脓毒症早期诊断的ROC曲线下面积(AUC)及95%可信区间(95% CI)分别为0.993(0.980~1.000)和0.944(0.873~1.000),提示其具有可靠的诊断价值。 结论:通过单细胞测序技术及数字PCR技术筛选得到的BATF、JUNB、CEACAM4、GNA15、C3AR1、TGFB1、MTCH1单核细胞差异基因集对脓毒症患者具有良好的早期诊断效能,或许能够为早期诊断脓毒症提供新思路。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
细胞因子作为重症登革热预警指征及其在发病中的作用研究
编辑人员丨1周前
目的:对普通登革热(DF)和重症登革热(SD)患者病程中不同时间点的细胞因子水平进行差异比较,筛选能作为SD早期预警指征的细胞因子,探讨免疫应答强度与SD发病的关系。方法:应用Luminex技术检测2014年6—12月在广州医科大学附属市八医院住院的120例登革热确诊患者(77例DF和43例SD患者)在急性期、退热期和恢复期的血浆中19种细胞因子和细胞黏附分子的水平,操作步骤按照试剂盒说明书严格进行;在前期实验的基础上选定的19种细胞因子包括:TNF-α、IL-6、IL-8、IL-10、IL-15、IL-17A、IFN-α2、IP-10、MCP-1、RANTES、GRO-α、PDGF-AA、PDGF-AB/BB、MIF、VEGF、sVCAM-1、sICAM-1、sFas及sFasL。应用荧光PCR法检测病毒载量并与细胞因子水平进行相关性分析。结果:TNF-α、IL-6、IL-8、IL-10、IL-15、IFN-α2、IP-10、MCP-1和sVCAM-1水平在登革热患者中升高,而RANTES、GRO-α和PDGF水平降低;IL-17A、MIF、VEGF、sICAM-1、sFas及sFasL水平无变化。TNF-α、IL-6、IFN-α2、IP-10和sVCAM-1水平在发病早期(第2~5天)的SD患者中显著高于DF患者,差异有统计学意义;在发病第6~10天,TNF-α、IL-6、IL-8、IL-10、IL-15、PDGF、RANTES、IFN-α2、IP-10和sVCAM-1水平在DF和SD患者之间差异有统计学意义。相关性分析结果显示:病毒载量与IL-15水平呈中等程度相关,与其他细胞因子水平仅弱相关或无相关。结论:TNF-α、IL-6、IFN-α2、IP-10和sVCAM-1可作为SD早期预警指征;多种细胞因子水平改变与SD发病相关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
整合素α4和细胞间黏附分子1的基因多态性与溃疡性结肠炎发病风险的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨整合素α4( ITGA4)和细胞间黏附分子1( ICAM-1)基因的基因多态性与溃疡性结肠炎(UC)发病风险的关系,并分析 ITGA4和 ICAM-1基因变异对维得利珠单抗(VDZ)治疗UC患者14周临床应答的影响。 方法:2010年1月1日至2023年1月31日于温州医科大学附属第二医院消化内科收集500例UC患者(UC组)及性别、年龄相匹配的529名健康对照(健康对照组)。将UC组患者分为轻度活动期264例和中重度活动期236例;远端结肠炎299例和广泛结肠炎201例;500例UC患者中,120例接受VDZ治疗,14周时78例获得临床应答,余42例无应答。采用卡方检验和非条件logistic回归模型并分别纳入显性、隐性、等位基因模型分析UC组与健康对照组、轻度活动期与中重度活动期UC患者、远端结肠炎与广泛结肠炎UC患者、临床应答与无应答UC患者的 ITGA4 rs6740847、rs7562325和 ICAM-1 rs5498的基因多态性差异。 结果:显性模型分析显示,UC组 ITGA4 rs6740847的变异等位基因G和变异基因型AG+GG频率均低于健康对照组(28.60%比33.18%、48.00%比56.15%), ITGA4 rs7562325的变异等位基因T和变异基因型CT+TT频率均高于健康对照组(37.30%比31.57%、62.20%比54.63%),差异均有统计学意义( χ2=5.04、6.83、7.49、6.06, P=0.025、0.009、0.006、0.014);中重度活动期UC患者 ITGA4 rs6740847的变异等位基因G和变异基因型AG+GG频率均低于轻度活动期UC患者(25.42%比31.44%、43.22%比52.27%), ITGA4 rs7562325的变异等位基因T和变异基因型CT+TT频率均高于轻度活动期UC患者(40.89%比34.09%、66.95%比57.96%),差异均有统计学意义( χ2=4.42、4.09、4.93、4.29, P=0.036、0.043、0.026、0.038);广泛结肠炎患者 ITGA4 rs6740847的变异等位基因G和变异基因型AG+GG频率、 ITGA4 rs7562325的变异等位基因T频率、 ICAM-1 rs5498的变异等位基因G和变异基因型AG+GG频率均低于远端结肠炎患者(24.38%比31.44%、39.80%比53.51%、33.58%比39.80%、19.65%比26.09%、35.82%比45.82%),差异均有统计学意义( χ2=5.87、9.05、3.97、5.54、4.94, P=0.015、0.003、0.046、0.019、0.026);临床应答患者 ITGA4 rs6740847的变异等位基因G和变异基因型AG+GG频率均高于无应答患者(34.62%比21.43%、61.54%比33.33%),差异均有统计学意义( χ2=4.52、8.70, P=0.039、0.001)。隐性基因模型分析显示,UC组 ITGA4 rs7562325变异基因型TT频率高于健康对照组(12.40%比8.51%),差异有统计学意义( χ2=4.18, P=0.041);中重度活动期UC患者 ICAM-1 rs5498的变异等位基因G和变异基因型GG频率均高于轻度活动期UC患者(27.33%比20.08%、8.47%比2.27%),差异均有统计学意义( χ2=7.30、9.72, P=0.007、0.002);临床应答患者 ITGA4 rs7562325变异等位基因型T和变异基因型TT频率均低于无应答患者(32.05%比45.24%、10.26%比23.81%),差异均有统计学意义( χ2=4.09、3.93, P=0.043、0.047)。 结论:ITGA4 rs6740847基因变异可能降低UC发病风险和疾病活动度,并可能提高UC患者对VDZ治疗的临床应答,而 ITGA4 rs7562325基因变异可能增加UC发病风险和疾病活动度,并可能降低UC患者对VDZ治疗的临床应答。 ICAM-1 rs5498基因变异可能加重UC疾病活动度。此外, ITGA4 rs6740847、rs7562325和 ICAM-1 rs5498基因变异都可能降低广泛结肠炎的发病风险。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
半胱氨酸蛋白酶-1基因缺陷对小鼠急性心肌梗死期血管屏障的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨半胱氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)对小鼠急性心肌梗死期血管通透性的影响及其分子机制。方法:本研究选取C57野生型(WT)小鼠和Caspase-1基因缺陷小鼠(Casp1 -/-)为研究对象,建立急性心肌梗死(AMI)模型;通过构建糖氧剥夺(OGD)模型来模拟内皮细胞中的AMI环境。2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)染色法观察各组小鼠心梗面积的大小;免疫印迹法检测相关蛋白表达水平的变化;免疫荧光染色法检测血管渗透性及观察各组黏附连接标志物的分布;酶联免疫吸附试验(ELISA)检测法检测细胞因子浓度,组间比较采用 t检验。 结果:Casp1 -/--AMI组梗死区域面积低于WT-AMI组(33.83±7.01比56.78±11.60, t=2.93, P<0.05);Casp1 -/--AMI组VE-cadherin的表达量高于WT-AMI组(0.87±0.14比0.43±0.11, t=4.37, P<0.05);OGD条件下VE-cadherin的表达具有相同的变化;Casp1 -/--AMI组细胞因子浓度低于WT-AMI组[(57.41±5.34)、(52.40±6.00) pg/ml比(73.80±6.16)、(69.84±4.68) pg/ml, t=4.50、 t=5.13, P<0.01];Casp1 -/-+Echinulin组VE-cadherin的表达水平明显低于Casp1 -/--normal组(0.31±0.05比0.95±0.15, t=7.23, P<0.01),差异均有统计学意义。 结论:Caspase-1基因缺陷可以通过调控核因子-κB通路发挥维持血管通透性,保护心脏功能的积极作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前